RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	FAB1	P34756	2278 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	PMT1	P33775	817 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YKL100C	P34248	587 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	FTH1	P38310	465 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	FAA2	P39518	744 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MEP1	P40260	492 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	NNF1	P47149	201 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SDH1	Q00711	640 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YOR342C	Q12182	319 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SEM1	O94742	89 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	KAR1	P11927	433 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SNF4	P12904	322 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MET8	P15807	274 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YKL097C	P34245	136 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SKG1	P36169	355 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	IML3	P38265	245 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	NBP35	P52920	328 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MPS1	P54199	764 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	PSR1	Q07800	427 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MED7	Q08278	222 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YDR056C	Q12025	205 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	PSY3	Q12318	242 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MHT1	Q12525	324 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SRN2	Q99176	213 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	STE3	P06783	470 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	CLN2	P20438	545 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	ATO2	P32907	282 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	GMH1	P36125	273 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	OMA1	P36163	345 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	BMT2	P38278	337 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	TAE1	P38340	232 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	DSS1	P39112	969 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	AYR1	P40471	297 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SNL1	P40548	159 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	KEL2	P50090	882 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RMR1	P53060	241 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	AQR1	P53943	586 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	EAR1	Q03212	550 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	EMI1	Q04406	187 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YKU80	Q04437	629 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	REH1	Q06709	432 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	ATG10	Q07879	167 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	FLC1	Q08967	793 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YPR011C	Q12251	326 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YLR122C	Q12312	125 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPN6	Q12377	434 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SNF8	Q12483	233 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	EMC3	P36039	253 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	INM1	P38710	295 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	UBA4	P38820	440 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	TDA11	P38854	504 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YHR218W	P38899	603 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MTW1	P39731	289 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	PFA3	P42836	336 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	GYP8	P43570	497 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	GCV1	P48015	400 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SAM37	P50110	327 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YGL108C	P53139	140 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YGR015C	P53208	328 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	NCE103	P53615	221 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	YNL260C	P53846	198 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SFB2	P53953	876 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MMT1	Q03218	510 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	ECM11	Q04110	302 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MLH3	Q12083	715 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MCD1	Q12158	566 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	RGT2	Q12300	763 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	MRP13	P12686	339 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YCK1	YHR135C	ATR1	P13090	542 aa		5.92	□□□□□ -1.46

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