RNA–Protein interactions for RNA: YGL246C

RAI1, Transcript of Nuclear protein with decapping endonuclease activity, yeast

Gene RAI1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAI1	YGL246C	MDM31	P38880	579 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAI1	YGL246C	HXT14	P42833	540 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAI1	YGL246C	SRB7	P47822	140 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAI1	YGL246C	VPS74	Q06385	345 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAI1	YGL246C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAI1	YGL246C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	BUD14	P27637	709 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SMF1	P38925	575 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RPH1	P39956	796 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	URB2	P47108	1174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	IRC15	Q02733	499 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	STH1	P32597	1359 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	NUP159	P40477	1460 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RPR2	P40571	144 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	COS10	P52924	374 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	PPT2	Q12036	173 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	CYB2	P00175	591 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	ATP11	P32453	318 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	NPL6	P32832	435 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RTT103	Q05543	409 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SET6	Q12529	373 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RED1	P14291	827 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YCR022C	P25620	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	ATS1	P31386	333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	ERG3	P32353	365 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	JNM1	P36224	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SHO1	P40073	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YDL186W	P48568	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YGL108C	P53139	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	AYT1	Q12226	474 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SCM3	Q12334	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	VPS15	P22219	1454 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	HAT2	P39984	401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SYG1	P40528	902 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	POP1	P41812	875 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	ELP2	P42935	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RTN2	Q12443	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RHO2	P06781	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	ATR1	P13090	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RAD14	P28519	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	FAU1	P40099	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	ALG8	P40351	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	YJL213W	P40896	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	RKM5	Q12367	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	SFI1	Q12369	946 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAI1	YGL246C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	BUB3	P26449	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	PMU1	P36069	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	GWT1	P47026	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	SNT2	P53127	1403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	AFG1	P32317	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	GYP6	P32806	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	YGR149W	P48236	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	SOV1	Q04748	898 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	VTA1	Q06263	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
RAI1	YGL246C	RRD2	Q12461	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	SPO14	P36126	1683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	CBP4	P37267	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	HEM2	P05373	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	SPS4	P09937	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	ATP10	P18496	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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