RNA–Protein interactions for RNA: YFR008W

FAR7, Transcript of Protein involved in recovery from pheromone-induced cell cycle arrest, yeast

Gene FAR7, Length 666 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAR7	YFR008W	CAF40	P53829	373 aa		2.81	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	JJJ1	P53863	590 aa		2.81	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	TAP42	Q04372	366 aa		2.81	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	SOV1	Q04748	898 aa		2.81	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	COG4	Q06096	861 aa		2.81	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.81	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	ATP10	P18496	279 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	GYP6	P32806	458 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	REC114	P32841	428 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	SMF1	P38925	575 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YPI1	P43587	155 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	POP6	P53218	158 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	PNG1	Q02890	363 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	TLG2	Q08144	397 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	GRX6	Q12438	231 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	RTP1	Q12751	981 aa		2.8	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	HIP1	P06775	603 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YOX1	P34161	385 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	NAT2	P37293	288 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YGL242C	P53066	181 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	DSL1	P53847	754 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	ODC1	Q03028	310 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	MUM3	Q08750	479 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YPL199C	Q08954	240 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	CHS1	P08004	1131 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	SPS4	P09937	338 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	PPH22	P23595	377 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	ROX1	P25042	368 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	SWE1	P32944	819 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	GCD10	P41814	478 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	PCP1	P53259	346 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	GOR1	P53839	350 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	ARK1	P53974	638 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	VPS72	Q03388	795 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	RRN11	Q04712	507 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	VTA1	Q06263	330 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAR7	YFR008W	RED1	P14291	827 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HEM15	P16622	393 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
FAR7	YFR008W	NDT80	P38830	627 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SPG5	P42933	373 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	VTC2	P43585	828 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YDR387C	Q04162	555 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YOR387C	Q08910	206 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RRD2	Q12461	358 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YBL059W	P34224	193 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HCS1	P34243	683 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YCR041W	P37265	110 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SDS24	P38314	527 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	VHC1	P38329	1120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YIL067C	P40514	678 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RRT5	P43607	289 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TRS85	P46944	698 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YIP1	P53039	248 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TAF11	Q04226	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HSP31	Q04432	237 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YLR287C	Q05881	355 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YLR108C	Q12259	485 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RTN2	Q12443	393 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YIM1	P28625	365 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	NIP100	P33420	868 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	ECM27	P47144	725 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	IBD2	P53892	351 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	PBA1	Q05778	276 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	ESA1	Q08649	445 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	CLC1	P17891	233 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	CLB3	P24870	427 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	CPR4	P25334	318 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SDH3	P33421	198 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SAS3	P34218	831 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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