RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 ARNTLO00327 626 aa6.87□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 ALX3O95076 343 aa6.87□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF205O95201 554 aa6.87□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.87□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 MFSD4AQ8N468 514 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 AIFM3Q96NN9 605 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 NACC1Q96RE7 527 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 IPPKQ9H8X2 491 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CHST12Q9NRB3 414 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 OXSMQ9NWU1 459 aa6.86□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.86□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 LEFTY1O75610 366 aa6.85□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.85□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.85□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.85□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 H7C1D1 291 aa6.84□□□□□ -1.31
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PIK3C3-211ENST00000589550 PHC1P78364 1004 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 GBX1Q14549 363 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 GRIK4Q16099 956 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 GPR158Q5T848 1215 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 USP33Q8TEY7 942 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 WHAMMQ8TF30 809 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 IL17RAQ96F46 866 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 SARGQ9BW04 601 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.84□□□□□ -1.31
PIK3C3-211ENST00000589550 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PIK3C3-211ENST00000589550 LTFP02788 710 aa6.83□□□□□ -1.32
PIK3C3-211ENST00000589550 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PIK3C3-211ENST00000589550 NOS3P29474 1203 aa6.83□□□□□ -1.32
PIK3C3-211ENST00000589550 LSAMPQ13449 338 aa6.83□□□□□ -1.32
PIK3C3-211ENST00000589550 NFKBIBQ15653 356 aa6.83□□□□□ -1.32
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