RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF576	Q9H609	170 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	NOD1	Q9Y239	953 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	POLR2M	P0CAP2	368 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	CASC1	Q6TDU7	716 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-225	ENST00000585084	CYTH3	O43739	400 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	MSRA	Q9UJ68	235 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PFKM	P08237	780 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PBX2	P40425	430 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	GRIN2C	Q14957	1233 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	RAB30	Q15771	203 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	DGKD	Q16760	1214 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	RETREG2	Q8NC44	543 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	LAMC2	Q13753	1193 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PGM5	Q15124	567 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	MTA3	Q9BTC8	594 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	BFSP2	Q13515	415 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	MAP3K14	Q99558	947 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	LY9	Q9HBG7	655 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	ZBBX	A8MT70	800 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PITPNM1	O00562	1244 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PRC1	O43663	620 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	DDAH1	O94760	285 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	CCND2	P30279	289 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	KIF5B	P33176	963 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	MCM5	P33992	734 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PTGIS	Q16647	500 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	TMTC2	Q8N394	836 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	RFC2	P35250	354 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	PPTC7	Q8NI37	304 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	KAT2B	Q92831	832 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	SESTD1	Q86VW0	696 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM87B	Q96K49	555 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	MYL10	Q9BUA6	226 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC69	A6NI79	296 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SLC27A2	O14975	620 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	RGS20	O76081	388 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	ACTN1	P12814	892 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	IL31RA	Q8NI17	732 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	IQCF3	P0C7M6	154 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	C7orf31	Q8N865	590 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	VWCE	Q96DN2	955 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	TGFB3	P10600	412 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SMARCA1	P28370	1054 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	PSEN2	P49810	448 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	GNAQ	P50148	359 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CAGE1	Q8TC20	777 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	ALG1	Q9BT22	464 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CDH23	Q9H251	3354 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	GGPS1	O95749	300 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA33	Q96N06	139 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	SORBS3	O60504	671 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	PPFIA4	O75335	1185 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF286B	P0CG31	522 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	MFSD10	Q14728	455 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	NECTIN1	Q15223	517 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	CUL5	Q93034	780 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-225	ENST00000585084	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		32.9	■■■□□ 2.86

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