RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 INPP5BP32019 993 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 PIK3CAP42336 1068 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 STMN2Q93045 179 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 CRCPO75575 148 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIFB4P59827 614 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 MIS12Q9H081 205 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2D6P10635 497 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MASTLQ96GX5 879 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ACCSQ96QU6 501 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 COL15A1P39059 1388 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 NEDD4P46934 1319 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CIB2O75838 187 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 P3H4Q92791 437 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TFDP1Q14186 410 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS52Q8N1B4 723 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CLIC2O15247 247 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MED10Q9BTT4 135 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP170P1Q96L14 293 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PLA2G4BP0C869 781 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPT2Q15019 361 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CDHR1Q96JP9 859 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ENC1O14682 589 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PPFIA4O75335 1185 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PALM2Q8IXS6 379 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MED14O60244 1454 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN9O14815 690 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM160B2Q86V87 743 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNA1P78396 465 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMD2Q13200 908 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 I3L4J1 428 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 VSTM4Q8IW00 320 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 POTEDQ86YR6 584 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ANO3Q9BYT9 981 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 THAP9Q9H5L6 903 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM206Q9H813 350 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 DISC1Q9NRI5 854 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF8O76064 485 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 NAA35Q5VZE5 725 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 RABGGTAQ92696 567 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT12Q99456 494 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO1FO00160 1098 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MESDQ14696 234 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM50Q86XT4 487 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMC1P11047 1609 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MADDQ8WXG6 1647 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 DPP9Q86TI2 863 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF131P52739 623 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP11AP98196 1134 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MGARPQ8TDB4 240 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CD209Q9NNX6 404 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 GIPC1O14908 333 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CNGA1P29973 690 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 STX2P32856 288 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PARVGQ9HBI0 331 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 STK36Q9NRP7 1315 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPREP23469 700 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP25P42331 645 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 NEDD9Q14511 834 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 RESP18Q5W5W9 173 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TTLL6Q8N841 843 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms