RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 COPS5Q92905 334 aa16.35■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.35■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 B4E1Z4 1266 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 MMP3P08254 477 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 TRDNQ13061 729 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 ADGRE1Q14246 886 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 CHST3Q7LGC8 479 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 ANKS1AQ92625 1134 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 AMNQ9BXJ7 453 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.34■□□□□ 0.21
CITED1-202ENST00000373619 CDH23Q9H251 3354 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CFBP00751 764 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CA3P07451 260 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 LAMC2Q13753 1193 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SESTD1Q86VW0 696 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 AFG1LQ8WV93 481 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.33■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ERICH2A1L162 156 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TLL1O43897 1013 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 EFCAB14O75071 495 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 MYOGP15173 224 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SELPP16109 830 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PTH1RQ03431 593 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 LY6KQ17RY6 165 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CPVLQ9H3G5 476 aa16.32■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SGSM2O43147 1006 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ARIH2O95376 493 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PPTC7Q8NI37 304 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TTC28Q96AY4 2481 aa16.31■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 NR3C2P08235 984 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP1Q07960 439 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PXMP2Q9NR77 195 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 COG5Q9UP83 839 aa16.3■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 KLRF2D3W0D1 207 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ZBTB5O15062 677 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PSEN2P49810 448 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PTK7Q13308 1070 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TET1Q8NFU7 2136 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D5Q92609 795 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ALG1Q9BT22 464 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CERS4Q9HA82 394 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.29■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 EMSYQ7Z589 1322 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PPFIA4O75335 1185 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 HSD17B4P51659 736 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 IKBKEQ14164 716 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 MFSD10Q14728 455 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TGFB3P10600 412 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CKBP12277 381 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 CCND2P30279 289 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 TAP1Q03518 808 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 RBL2Q08999 1139 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 GNPTABQ3T906 1256 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 VWCEQ96DN2 955 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 SPATA33Q96N06 139 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 COL20A1Q9P218 1284 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.27■□□□□ 0.2
CITED1-202ENST00000373619 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms