RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C GPI10P30777 616 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SHP1P34223 423 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C VID24P38263 362 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C MTC4P38335 694 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C ALK1P43633 760 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C TWF1P53250 332 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C JJJ1P53863 590 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C TAF11Q04226 346 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C GLO2Q05584 274 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C RIM20Q12033 661 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C ATR1P13090 542 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C PRP2P20095 876 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SEC62P21825 274 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C ROX1P25042 368 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YCR022CP25620 114 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C PMT1P33775 817 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C MRPL4P36517 319 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C MUM2P38236 366 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C VPS52P39904 641 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SRB7P47822 140 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C ALT2P52892 507 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YGL082WP53155 381 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YLR287CQ05881 355 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SYO1Q07395 620 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C ATG29Q12092 213 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C GRX6Q12438 231 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SEC39Q12745 709 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa1.79□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YML133CQ03099 1374 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YLL067CQ07888 1374 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YLL066CQ99208 1374 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C COR1P07256 457 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C RED1P14291 827 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C APE1P14904 514 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C PTR2P32901 601 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C CMC1P36064 111 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C DUG2P38149 878 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C BNA4P38169 460 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C TCM62P38228 572 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C OSH3P38713 996 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C MBB1P39534 108 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C NOC2P39744 710 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YJR154WP47181 346 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C PDS5Q04264 1277 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C BSC6Q08280 497 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YDL009CQ12210 107 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C RTN2Q12443 393 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C YCL021W-AQ96VH3 125 aa1.78□□□□□ -2.12
HDA3YPR179C SUC2P00724 532 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ERG3P32353 365 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MSN2P33748 704 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YNK1P36010 153 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PMU1P36069 295 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YBP1P38315 674 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SLX1P38324 304 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SMF1P38925 575 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HXT14P42833 540 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data1.78□□□□□ -2.13 RIP-Chip
HDA3YPR179C ZPR1P53303 486 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C ADD37Q03233 198 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SLD5Q03406 294 aa1.78□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RAV1P47104 1357 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C UTR4P32626 227 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SEC66P33754 206 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MSO1P53604 210 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RLI1Q03195 608 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C IVY1Q04934 453 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RQC1Q05468 723 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PHO92Q06390 306 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HNT3Q08702 217 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SCM3Q12334 223 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YOL159C-AQ3E769 90 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YER078W-AQ3E7A2 54 aa1.77□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C MES1P00958 751 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C FUR1P18562 216 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C YCR007CP25354 239 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C FRE1P32791 686 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C NPL6P32832 435 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SAS3P34218 831 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C SLG1P54867 378 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C TAP42Q04372 366 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C CAR1P00812 333 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C RRT2P38332 387 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C OTU2P38747 307 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C HAT2P39984 401 aa1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C PRE5P40302 234 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
HDA3YPR179C POP1P41812 875 aa1.76□□□□□ -2.13
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