RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	ECM11	Q04110	302 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YDR124W	Q04608	324 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GGA1	Q06336	557 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HUA2	Q12134	243 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PEX6	P33760	1030 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YBL029W	P38201	376 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GIP4	P39732	760 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CAF120	P53836	1060 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MPS1	P54199	764 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SDH1	Q00711	640 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GIP3	Q03016	1276 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SUL2	Q12325	893 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HTA2	P04912	132 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	CSM1	P25651	190 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	STE14	P32584	239 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GGC1	P38988	300 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SSU1	P41930	458 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YGL176C	P46945	554 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MPS3	P47069	682 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	COS12	P53053	380 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	IRC15	Q02733	499 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SPC2	Q04969	178 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PSR1	Q07800	427 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	TFB4	Q12004	338 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YDR056C	Q12025	205 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NSL1	Q12143	216 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MHT1	Q12525	324 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HXT4	P32467	576 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YCR087C-A	P37263	153 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	INM1	P38710	295 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HXT7	P39004	570 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	FMP32	P43557	207 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	DYN3	Q04949	312 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SRN2	Q99176	213 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ATP6	P00854	259 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PHO81	P17442	1178 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
AMD1	YML035C	TFB1	P32776	642 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SEC66	P33754	206 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NUF2	P33895	451 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PIM1	P36775	1133 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MUM2	P38236	366 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YAL037W	P39728	267 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	AYR1	P40471	297 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	NUP85	P46673	744 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	GTO1	P48239	356 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MRK1	P50873	501 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SWS2	P53937	143 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	TRM82	Q03774	444 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	ORM2	Q06144	216 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	REH1	Q06709	432 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	SGT1	Q08446	395 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	PFA4	Q12006	378 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	YPR011C	Q12251	326 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RGT2	Q12300	763 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	JLP1	Q12358	412 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	MRP13	P12686	339 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	DIA3	P52290	468 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	EAF1	Q06337	982 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AMD1	YML035C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	URA4	P20051	364 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	CCA1	P21269	546 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	NPL6	P32832	435 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	EMC3	P36039	253 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	PTR3	P43606	678 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	HXT15	P54854	567 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	MMT1	Q03218	510 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	YFT2	Q06676	274 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	TYR1	P20049	452 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	ATP7	P30902	174 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	ELO1	P39540	310 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	CAB2	P40506	365 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AMD1	YML035C	IMA5	P40884	581 aa		5.52	□□□□□ -1.53

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