RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	GEX1	P25596	615 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	KRE2	P27809	442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	MGM1	P32266	881 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	ATP11	P32453	318 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	PHD1	P36093	366 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SPC34	P36131	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	ARA1	P38115	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	PCL6	P40038	420 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	ATF1	P40353	525 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RTS2	P40962	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YGR016W	P53209	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SMA1	Q02651	245 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	UAF30	Q08747	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	VAM3	Q12241	283 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SKS1	Q12505	502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	ATP10	P18496	279 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	CLN1	P20437	546 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YCR007C	P25354	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YNL234W	P53857	426 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RSF1	Q05043	376 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	THI7	Q05998	598 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	DIC1	Q06143	298 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SPT7	P35177	1332 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YPR089W	O13585	888 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	BAR1	P12630	587 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	URA4	P20051	364 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	BRF1	P29056	596 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	HIR2	P32480	875 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	UTR4	P32626	227 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	PEX2	P32800	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	HEL1	P36113	551 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	VHC1	P38329	1120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	FLO5	P38894	1075 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	ECM27	P47144	725 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	CUL3	P53202	744 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	IZH1	Q03419	316 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	DCI1	Q08558	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SEC63	P14906	663 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	MDM10	P18409	493 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SPO7	P18410	259 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SIN4	P32259	974 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	REC114	P32841	428 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	PDR3	P33200	976 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SCO2	P38072	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	ERG7	P38604	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RFC3	P38629	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	YHR054C	P38780	354 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	CSM2	P40465	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	EFM4	P40516	257 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	SYG1	P40528	902 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	FET5	P43561	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	GAT1	P43574	510 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	THI20	Q08224	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS31	YLR167W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	DPH2	P32461	534 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ANP1	P32629	500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SWH1	P35845	1188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SER3	P40054	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YTA12	P40341	825 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	XBP1	P40489	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YJL132W	P47014	750 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	GPI1	P53306	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ESBP6	P53918	673 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SAM50	P53969	484 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MSS11	Q03825	758 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	GLO2	Q05584	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	BNA5	Q05979	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	DCS1	Q06151	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	VPS54	Q12071	889 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	AEP3	Q12089	606 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	HER1	Q12276	1246 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	CBP4	P37267	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MMS4	P38257	691 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SPC97	P38863	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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