RNA–Protein interactions for RNA: YJL019W

MPS3, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene MPS3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MPS3	YJL019W	MDM12	Q92328	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SPT14	P32363	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MSC7	P38694	644 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YHK8	P38776	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SER2	P42941	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GYP8	P43570	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	BST1	P43571	1029 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	EAF6	P47128	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ECL1	P48235	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GNP1	P48813	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NAS6	P50086	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	DAM1	P53267	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YGR117C	P53270	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
MPS3	YJL019W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PET117	Q02771	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PFA5	Q03289	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	BLS1	Q06071	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GSH2	Q08220	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ACF2	Q12168	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NSI1	Q12457	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	CTF3	Q12748	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PPQ1	P32945	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NIC96	P34077	839 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GLG1	P36143	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPH1	P39956	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MIT1	P40002	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	FKH2	P41813	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	BIO3	P50277	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ROM1	P53046	1155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GND2	P53319	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NUP49	Q02199	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GRX5	Q02784	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SPO20	Q04359	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RIF2	Q06208	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	VTA1	Q06263	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	TRE2	Q08693	809 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
MPS3	YJL019W	ATP16	Q12165	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RAD59	Q12223	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	JLP1	Q12358	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPN6	Q12377	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GTT2	Q12390	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ATG31	Q12421	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YPR1	Q12458	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PRC1	P00729	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	DIT1	P21623	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GRR1	P24814	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RHB1	P25378	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GAC1	P28006	793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PEP7	P32609	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NAT2	P37293	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RIB1	P38066	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YIR007W	P40566	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ALR2	P43553	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GTO1	P48239	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PEX13	P80667	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MAK3	Q03503	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	ARA2	Q04212	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GRX8	Q05926	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GRS2	Q06817	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	GPB1	Q08886	897 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	NUS1	Q12063	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	FMP16	Q12497	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	COX5A	P00424	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	PDE2	P06776	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	SCD5	P34758	872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MPS3	YJL019W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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