RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HOM2P13663 365 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W CSM1P25651 190 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HXT4P32467 576 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MGM101P32787 269 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HES1P35843 434 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W IST2P38250 946 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W BMT2P38278 337 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W INM1P38710 295 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W PFS1P38872 237 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HXT6P39003 570 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HXT7P39004 570 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GIM4P40005 111 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YJL070CP40361 888 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W IMA5P40884 581 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MPS3P47069 682 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W DIA3P52290 468 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GIP3Q03016 1276 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HSP31Q04432 237 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W NSL1Q12143 216 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YCL012CQ8J0M4 134 aa8.62□□□□□ -1.03
DDI1YER143W POL30P15873 258 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W CCA1P21269 546 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W TCD2P36101 447 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YBR071WP38243 211 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W FMO1P38866 432 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W BAT1P38891 393 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MEP2P41948 499 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MDJ2P42834 146 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ILM1P47155 203 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YNL260CP53846 198 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data8.61□□□□□ -1.03not detected
DDI1YER143W YPR011CQ12251 326 aa8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
DDI1YER143W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W TPK2P06245 380 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MRP13P12686 339 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SPT15P13393 240 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SCL1P21243 252 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SGV1P23293 657 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W HCM1P25364 564 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W DEF1P35732 738 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MRPL37P36532 105 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ROT2P38138 954 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W AXL2P38928 823 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GGC1P38988 300 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W NDE1P40215 560 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W AYR1P40471 297 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GTO1P48239 356 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W COS12P53053 380 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ART5P53244 586 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ATP25Q03153 612 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W BSC2Q05611 235 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ATG26Q06321 1198 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W EAF1Q06337 982 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W PFA4Q12006 378 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YDR056CQ12025 205 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ATG29Q12092 213 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SUL2Q12325 893 aa8.6□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ARG81P05085 880 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W LEU4P06208 619 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W RAP1P11938 827 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W UGA1P17649 471 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W RDS2P19541 446 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W FUN30P31380 1131 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SIN4P32259 974 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W TFC1P32367 649 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SRX1P36077 127 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MRPL17P36528 281 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W DED81P38707 554 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W GIC1P38785 314 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MET12P46151 657 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W TY4A-JP47023 414 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W ERP6P53198 216 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W CAF120P53836 1060 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W RGT2Q12300 763 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W SRN2Q99176 213 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W NHA1Q99271 985 aa8.59□□□□□ -1.03
DDI1YER143W MSB2P32334 1306 aa8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.58□□□□□ -1.04not detected
DDI1YER143W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YCR087C-AP37263 153 aa8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RRP3P38712 501 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TIF34P40217 347 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W AIM22P47051 409 aa8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W NOP9P47077 666 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SGF73P53165 657 aa8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W IDP3P53982 420 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YOL159CQ08300 171 aa8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RTT10Q08924 1013 aa8.58□□□□□ -1.04
DDI1YER143W FMP27Q06179 2628 aa8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SLM5P25345 492 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RPT5P33297 434 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W PDX3P38075 228 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms