RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W INO80P53115 1489 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W COR1P07256 457 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MAK32P23060 363 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W GSY2P27472 705 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W KRE2P27809 442 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MSS51P32335 436 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RPC34P32910 317 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W SHP1P34223 423 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ANS1P38832 159 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W FAD1P38913 306 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MLH1P38920 769 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MBB1P39534 108 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W VHS2P40463 436 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W CDC1P40986 491 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W EPL1P43572 832 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YTP1P53584 459 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YNR068CP53754 272 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W SPH1Q06160 661 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ATG26Q06321 1198 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YFH1Q07540 174 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ULA1Q12059 462 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W UBX3Q12229 455 aa3.05□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RIP1P08067 215 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W GPA1P08539 472 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W DAL80P26343 269 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W HIR2P32480 875 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W SUR1P33300 382 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W SRB2P34162 210 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W OCT1P35999 772 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PXL1P36166 706 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YHR210CP38893 341 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YER130CP39959 443 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RTT105P40063 208 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W OSW5P40219 148 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YIL089WP40500 205 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W SNG1P46950 547 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ORC5P50874 479 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W THP1Q08231 455 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MDY2Q12285 212 aa3.04□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W AQY1P0CD91 305 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W TAL1P15019 335 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W NUP1P20676 1076 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YCR006CP25350 157 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W GEX1P25596 615 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PCH2P38126 564 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PFF1P38244 976 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W APD1P38281 316 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W VHC1P38329 1120 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ARP1P38696 384 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W UBA4P38820 440 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ERV46P39727 415 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YJL043WP47053 257 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
RTT105YER104W AQR1P53943 586 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ARP5P53946 755 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PDR8Q06149 701 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PIG1Q06216 648 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W NDL1Q06568 189 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YDL057WQ07379 328 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W MCH4Q08268 501 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W YOR365CQ08844 703 aa3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
RTT105YER104W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
RTT105YER104W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RTT105YER104W PDE2P06776 526 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W PMR1P13586 950 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W ATP10P18496 279 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W CNA1P23287 553 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W BEM1P29366 551 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W FAA1P30624 700 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W SIN4P32259 974 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W NDI1P32340 513 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W REC114P32841 428 aa3.02□□□□□ -1.93
RTT105YER104W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
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