RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	ESL1	P40456	1118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RET3	P53600	189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SGF29	P25554	259 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PEX2	P32800	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	OCT1	P35999	772 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	FLC2	P39719	783 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YLR462W	O13556	202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SPS22	P25380	463 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SIN4	P32259	974 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ORC2	P32833	620 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NUF2	P33895	451 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YKL050C	P35736	922 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YBL029W	P38201	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YHL049C	P38722	271 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YEL075C	P39972	122 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YER189W	P40104	122 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NDE1	P40215	560 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	AIM20	P40451	204 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PKP1	P40530	394 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YFL064C	P43540	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YFR020W	P43600	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RSC9	Q03124	581 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ORM2	Q06144	216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YLH47	Q06493	454 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CIR2	Q08822	631 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	HUA2	Q12134	243 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SPE4	Q12455	300 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MSS51	P32335	436 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	BUD2	P33314	1104 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SAS3	P34218	831 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YBR032W	P38223	100 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	HIS2	P38635	335 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	UIP3	P39547	235 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	IAH1	P41734	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	AIM33	Q04516	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TCO89	Q08921	799 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RAD61	Q99359	647 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TYR1	P20049	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	STE50	P25344	346 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YBR225W	P38321	900 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	HSM3	P38348	480 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	JJJ1	P53863	590 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	IRC4	Q03036	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PDR8	Q06149	701 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PSR1	Q07800	427 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	DSE3	Q08729	430 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CBF1	P17106	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NPL6	P32832	435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	BLI1	P35727	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	VHC1	P38329	1120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RRT2	P38332	387 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ALG5	P40350	334 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SNO3	P43544	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	INP2	Q03824	705 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SEG1	Q04279	960 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	THI7	Q05998	598 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MCH4	Q08268	501 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	FLO1	P32768	1537 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YCR006C	P25350	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	COQ3	P27680	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	KAR9	P32526	644 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MSG5	P38590	489 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RFC3	P38629	340 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NPR2	P39923	615 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	FMS1	P50264	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CSM3	Q04659	317 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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