RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	BOS1	P25385	244 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	KAR9	P32526	644 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	ATG12	P38316	186 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	YBR225W	P38321	900 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	FRT2	P39734	528 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	SCC4	P40090	624 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	BUR6	P40096	142 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	GAT2	P40209	560 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	PTR3	P43606	678 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	DIA3	P52290	468 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	YPS5	P53057	165 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	DSD1	P53095	428 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TEP1	P53916	434 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	YMR102C	Q03177	834 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	YMR181C	Q03231	154 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TEN1	Q07921	160 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	NUS1	Q12063	375 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TY2A-B	Q12260	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	IES6	P32617	166 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	GPI18	P38211	433 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	FAR3	P46671	204 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	YJL144W	P47009	104 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	URB2	P47108	1174 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	MCH1	Q07376	486 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	VCX1	Q99385	411 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	PRY2	P36110	329 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	PFF1	P38244	976 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	CIN4	P39110	191 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	MST28	P39552	234 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	IME4	P41833	600 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	VPS4	P52917	437 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
YBL053W	YBL053W	RKM5	Q12367	367 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YBL053W	YBL053W	TRP1	P00912	224 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YAR066W	P0CX18	203 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YHR214W	P0CX19	203 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	CLB4	P24871	460 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YCR100C	P25606	316 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	CBK1	P53894	756 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	PNG1	Q02890	363 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	MUB1	Q03162	620 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RTT109	Q07794	436 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YOR019W	Q99248	730 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	BUB3	P26449	341 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RTC2	P38279	296 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	ICS2	P38284	255 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	OM14	P38325	134 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YER184C	P39961	794 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	BIO3	P50277	480 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	COG1	P53079	417 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	COG6	P53959	839 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	ADA2	Q02336	434 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	PSR1	Q07800	427 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	PLB3	Q08108	686 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	IZH2	Q12442	317 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RPB5	P20434	215 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	VMA16	P23968	213 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RML2	P32611	393 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	CSE2	P33308	149 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SSU1	P41930	458 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YJR142W	P47173	342 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	PPM1	Q04081	328 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	IOC4	Q04213	475 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YOL114C	Q12322	202 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	TPK1	P06244	397 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	SKN1	P33336	771 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	NUP133	P36161	1157 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	YBR138C	P38277	524 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YBL053W	YBL053W	MDE1	P47095	244 aa		0.37	□□□□□ -2.35

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