RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TRS20	P38334	175 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RCK1	P38622	512 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPT8	P38915	602 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AVT2	P39981	480 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YEL057C	P39983	233 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YND1	P40009	630 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL195C	P40168	261 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AVT7	P40501	490 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IRR1	P40541	1150 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CUP9	P41817	306 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ZIM17	P42844	174 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BNA1	P47096	177 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VEL1	P53058	206 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ATP23	P53722	227 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CPR8	P53728	308 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL146W	P53906	100 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL143C	P53908	130 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ASI1	P54074	624 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MSC1	Q03104	513 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NGL3	Q03210	505 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YDR209C	Q03480	137 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GAS3	Q03655	524 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRM6	Q04705	352 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VHS3	Q08438	674 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPE4	Q12455	300 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NCB2	Q92317	146 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FLO9	P39712	1322 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MRS3	P10566	314 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HMG1	P12683	1054 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HOP1	P20050	605 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DAL81	P21657	970 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ERG8	P24521	451 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRD1	P25375	712 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPC53	P25441	422 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MEI4	P29467	408 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ANP1	P32629	500 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MTC7	P32633	139 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPC37	P36121	282 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YHL041W	P38730	149 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ECM14	P38836	430 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	FRT2	P39734	528 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DSE1	P40077	573 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DDI1	P40087	428 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RAD26	P40352	1085 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YIL024C	P40543	189 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJL107C	P42947	387 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AIM14	P53109	570 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YGL081W	P53156	320 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YGR127W	P53275	312 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL193W	P53870	558 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MTQ1	P53944	314 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TIM10	P87108	93 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YMR210W	Q03649	449 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CSM3	Q04659	317 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NRT1	Q08485	598 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TPO4	Q12256	659 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CDC21	P06785	304 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPO7	P18410	259 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CLN2	P20438	545 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DBF2	P22204	572 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MAK31	P23059	88 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SKN1	P33336	771 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HES1	P35843	434 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BET3	P36149	193 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PBY1	P38254	753 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	OPY1	P38271	328 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IFA38	P38286	347 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	KRE9	P39005	276 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FTR1	P40088	404 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LRO1	P40345	661 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34

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