RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 PEX10O60683 326 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 RPS6P62753 249 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 CCNA1P78396 465 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 SREBF1P36956 1147 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 USP11P51784 963 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 IFNL1Q8IU54 200 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 WNT7AO00755 349 aa27.15■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP4P98171 946 aa27.15■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 PPP6R2O75170 966 aa27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 UBE2HP62256 183 aa27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 SLC30A10Q6XR72 485 aa27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 MROH8Q9H579 483 aa27.14■■□□□ 1.94
MEIS3-204ENST00000558555 PFASO15067 1338 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ERCC3P19447 782 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD35Q8N283 1001 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 SHCBP1Q8NEM2 672 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 PTGDRQ13258 359 aa27.13■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 Q3C1V9 767 aa27.13■■□□□ 1.93
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MEIS3-204ENST00000558555 TM4SF4P48230 202 aa27.12■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.12■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 COL20A1Q9P218 1284 aa27.12■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 LAD1O00515 517 aa27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 NEMFO60524 1076 aa27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 MOXD1Q6UVY6 613 aa27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CYP3A4P08684 503 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF76P36508 570 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 WDR78Q5VTH9 848 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 TDP2O95551 362 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 TAAR1Q96RJ0 339 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 RMDN3Q96TC7 470 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 RPTORQ8N122 1335 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 MBD3O95983 291 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ADALQ6DHV7 355 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 FERMT2Q96AC1 680 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 EDIL3O43854 480 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CUTAO60888 179 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 CYP3A7P24462 503 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-204ENST00000558555 PTPREP23469 700 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 CIITAP33076 1130 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 UBXN2AP68543 259 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 KCTD2Q14681 263 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 MMP19Q99542 508 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 FRMPD4Q14CM0 1322 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 TRPA1O75762 1119 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 ALDH1A1P00352 501 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 OR52Z1P0C646 297 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 FCER1AP12319 257 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 CALCRLQ16602 461 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 PXMP2Q9NR77 195 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.07■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 PRPHP41219 470 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 POTEDQ86YR6 584 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 MBOAT7Q96N66 472 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 PORCNQ9H237 461 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM60Q9H2L4 133 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 EFCC1Q9HA90 598 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 RNF186Q9NXI6 227 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 CPA4Q9UI42 421 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1W2PQ27 194 aa27.05■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1W2PQ64 194 aa27.05■■□□□ 1.92
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1W2PQD8 194 aa27.05■■□□□ 1.92
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