RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 ARHGEF15O94989 841 aa20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-208ENST00000531857 BMP1P13497 986 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-208ENST00000531857 EDNRBP24530 442 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-208ENST00000531857 HAND2P61296 217 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-208ENST00000531857 ZNF543Q08ER8 600 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-208ENST00000531857 PPP2R5BQ15173 497 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-208ENST00000531857 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-208ENST00000531857 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-208ENST00000531857 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PKP3-208ENST00000531857 COL20A1Q9P218 1284 aa20.3■□□□□ 0.84
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PKP3-208ENST00000531857 CHST3Q7LGC8 479 aa20.28■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 KIF28PB7ZC32 967 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 TLL1O43897 1013 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 GH1P01241 217 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 TCTN1Q2MV58 587 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP3-208ENST00000531857 SESTD1Q86VW0 696 aa20.27■□□□□ 0.84
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