RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT23	Q9C075	422 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	NAPB	Q9H115	298 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMT1	Q9H993	441 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMA4	Q16363	1823 aa		6.48	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	MYH7	P12883	1935 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	UNCX	A6NJT0	531 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247		J3QW42	95 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R082	166 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ORC4	O43929	436 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	JAK2	O60674	1132 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	KLRK1	P26718	216 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	COL8A1	P27658	744 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	HAND2	P61296	217 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS37D	Q86XT2	251 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	SP8	Q8IXZ3	490 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	LY9	Q9HBG7	655 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	LTBP1	Q14766	1721 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	NEDD4	P46934	1319 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	STK36	Q9NRP7	1315 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		6.46	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		6.46	□□□□□ -1.37
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR182	O15218	404 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKAB2	O43741	272 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHA2	P01877	340 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PSAP	P07602	524 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RXRB	P28702	533 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT85	P78386	507 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GPLD1	P80108	840 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GPSM2	P81274	684 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FGD1	P98174	961 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MECOM	Q03112	1051 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PPARA	Q07869	468 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP2R5B	Q15173	497 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NTRK3	Q16288	839 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	APOA5	Q6Q788	366 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	USP48	Q86UV5	1035 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GJD3	Q8N144	294 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TMTC2	Q8N394	836 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CITED4	Q96RK1	184 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM129B	Q96TA1	746 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		6.46	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CASZ1	Q86V15	1759 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247		B4E1Z4	1266 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TREH	O43280	583 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CDKL5	O76039	1030 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	APBA3	O96018	575 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	APP	P05067	770 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SRGN	P10124	158 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NPR1	P16066	1061 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TDO2	P48775	406 aa		6.45	□□□□□ -1.38

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