RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466195.1

TSPAN13-202, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN13, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-202ENST00000466195 GNAQP50148 359 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 CPT1AP50416 773 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 NKX3-2P78367 333 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 KRT32Q14532 448 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 TTLL4Q14679 1199 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 STXBP2Q15833 593 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 TBC1D5Q92609 795 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 MTMR8Q96EF0 704 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 NEK1Q96PY6 1258 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 IWS1Q96ST2 819 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 LTBP2Q14767 1821 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 ARVCFO00192 962 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 MYL10Q9BUA6 226 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 POLR2MP0CAP2 368 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 HSD17B4P51659 736 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 FGD1P98174 961 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 BADQ92934 168 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN13-202ENST00000466195 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 CTAGE5O15320 804 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 MYL3P08590 195 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 SMARCA1P28370 1054 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 ITGA7Q13683 1181 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 CUL5Q93034 780 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PXMP2Q9NR77 195 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 COL20A1Q9P218 1284 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 KIAA0355O15063 1070 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 CYTH3O43739 400 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 REC8O95072 547 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 NR3C2P08235 984 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 CDK7P50613 346 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 GHRHRQ02643 423 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 FAAP100Q0VG06 881 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 MICU3Q86XE3 530 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 KPNA6O60684 536 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 GH1P01241 217 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 RXRAP19793 462 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PTGS1P23219 599 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 FPGSQ05932 587 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 FANCBQ8NB91 859 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 OPLAHO14841 1288 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 TIMP1P01033 207 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 CCND2P30279 289 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PGM5Q15124 567 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 COPS5Q92905 334 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 A6NJR5 290 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13-202ENST00000466195 ZBTB43O43298 467 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms