RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 AKR1A1P14550 325 aa26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 MCM2P49736 904 aa26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 PHKBQ93100 1093 aa26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 ME3Q16798 604 aa26.96■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 MCTP2Q6DN12 878 aa26.96■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.96■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 TAAR1Q96RJ0 339 aa26.96■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.96■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.95■■□□□ 1.91
GLI3-202ENST00000428534 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 EDNRBP24530 442 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 GNA11P29992 359 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 STXBP2Q15833 593 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 WASF1Q92558 559 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 GTF3C6Q969F1 213 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 SHISA4Q96DD7 197 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.95■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ESYT2A0FGR8 921 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 STXBP3O00186 592 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 XBP1P17861 261 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 TRPV1Q8NER1 839 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 BICD2Q8TD16 824 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 C6orf50Q9HD87 102 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 PXMP2Q9NR77 195 aa26.94■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 STK36Q9NRP7 1315 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 SMCO2A6NFE2 343 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 MEIS2O14770 477 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 RARBP10826 455 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ADCY7P51828 1080 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 PKN1Q16512 942 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 IQSEC1Q6DN90 963 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 COL20A1Q9P218 1284 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.93■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ASTN1O14525 1302 aa26.92■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.92■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 STAM2O75886 525 aa26.92■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.92■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 NR3C2P08235 984 aa26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 LHX8Q68G74 356 aa26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ARRDC4Q8NCT1 418 aa26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 CCND2P30279 289 aa26.9■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.9■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 KATNBL1Q9H079 304 aa26.9■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 SPC25Q9HBM1 224 aa26.9■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 AP3B2Q13367 1082 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 PGM5Q15124 567 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 GALNT17Q6IS24 598 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 NECAB1Q8N987 351 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 SCFD2Q8WU76 684 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 Q9Y3F1 56 aa26.89■■□□□ 1.9
GLI3-202ENST00000428534 SZT2Q5T011 3432 aa26.88■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 TNFAIP2Q03169 654 aa26.88■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.88■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 H0YGN5 161 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 TTLL4Q14679 1199 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 TAPT1Q6NXT6 567 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 RNF180Q86T96 592 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 LARGE1O95461 756 aa26.86■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 NLRP5P59047 1200 aa26.86■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 GNPTABQ3T906 1256 aa26.86■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.86■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.86■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.86■■□□□ 1.89
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