RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 STK4Q13043 487 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEDQ86YR6 584 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA1Q8ND90 353 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP58Q9BVL2 599 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 FCER1AP12319 257 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 INPP5BP32019 993 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 VAV2P52735 878 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ITIH3Q06033 890 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE4DQ08499 809 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF5AQ12840 1032 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MIIPQ5JXC2 388 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 P2RX5Q93086 422 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MYL1P05976 194 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SKOR1P84550 965 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TFAP4Q01664 338 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMM50Q9Y512 469 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMB1P07942 1786 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L8P0C7I0 530 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TTMPQ5BVD1 217 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 RETREG2Q8NC44 543 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 HPS3Q969F9 1004 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL8AQ96BM9 186 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM9Q9C026 710 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.35■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 FLT1P17948 1338 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CYTH3O43739 400 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNE1P24864 410 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNRD1Q16881 649 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC96Q2M329 555 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ALS2CLQ60I27 953 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC42Q96M95 316 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 EPHB4P54760 987 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ASIC1P78348 528 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC7A5Q01650 507 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM58Q8NG06 486 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.34■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK17Q00537 523 aa20.33■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CABP7Q86V35 215 aa20.33■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.33■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH1P12882 1939 aa20.33■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.33■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 TACC1O75410 805 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 PRLRP16471 622 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 CNPY4Q8N129 248 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMB7Q99436 277 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 BICDL2A1A5D9 508 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L3A6NCW0 530 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L4A6NCW7 530 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 EPHB6O15197 1021 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 HSF2BPO75031 334 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 SPA17Q15506 151 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 SBK1Q52WX2 424 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 EMBQ6PCB8 327 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 CNBD1Q8NA66 436 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH10P35580 1976 aa20.32■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 STXBP3O00186 592 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 GYS1P13807 737 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 MNAT1P51948 309 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 GPATCH11Q8N954 259 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 CAVIN3Q969G5 261 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 RUFY1Q96T51 708 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.31■□□□□ 0.84
RALGPS1-208ENST00000424082 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms