RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	ERVK-9	P63128	1117 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	ERVK-24	P63145	666 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	IFNL1	Q8IU54	200 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	MAF1	Q9H063	256 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	COL20A1	Q9P218	1284 aa		14.03	□□□□□ -0.16
FAAP20-208	ENST00000420964	PFAS	O15067	1338 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	RPTOR	Q8N122	1335 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP6R2	O75170	966 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ERCC3	P19447	782 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	INHBE	P58166	350 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	UBE2H	P62256	183 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP4	P98171	946 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	EDIL3	O43854	480 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	NEMF	O60524	1076 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TDP2	O95551	362 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	USP11	P51784	963 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CCNA1	P78396	465 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	NOG	Q13253	232 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PTGDR	Q13258	359 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964		Q3C1V9	767 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PLXNB2	O15031	1838 aa		14.01	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC37A4	O43826	429 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP3A4	P08684	503 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	POTED	Q86YR6	584 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MROH8	Q9H579	483 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		14	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	LAD1	O00515	517 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MBD3	O95983	291 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP3A7	P24462	503 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TM4SF4	P48230	202 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	UBXN2A	P68543	259 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PORCN	Q9H237	461 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.99	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PQ27	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PQ64	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PQD8	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CUTA	O60888	179 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PTPRE	P23469	700 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CIITA	P33076	1130 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF76	P36508	570 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PRPH	P41219	470 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CALCRL	Q16602	461 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MMP19	Q99542	508 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.98	□□□□□ -0.17

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