RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 FOCADQ5VW36 1801 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 IVLP07476 585 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CYP27A1Q02318 531 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 GRB10Q13322 594 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CALCRLQ16602 461 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 MAN2A1Q16706 1144 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC96Q2M329 555 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 MTMR9Q96QG7 549 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 PIGSQ96S52 555 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 NDST4Q9H3R1 872 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 JADE2Q9NQC1 790 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 RPS6KA5O75582 802 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC63Q05C16 580 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 TEX11Q8IYF3 940 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 COG1Q8WTW3 980 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CEP95Q96GE4 821 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 RAB34Q9BZG1 259 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 SH2D4AQ9H788 454 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF263O14978 683 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 TACC1O75410 805 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 TXKP42681 527 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 NOVP48745 357 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 NFIXQ14938 502 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 HPS3Q969F9 1004 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 SNX12Q9UMY4 172 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 MYMKA6NI61 221 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 LCA5LO95447 670 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 ITIH3Q06033 890 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 RUBCNQ92622 972 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 KIF11P52732 1056 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 PNMA5Q96PV4 448 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF185O15231 689 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 RNF40O75150 1001 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PRLRP16471 622 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ADCY7P51828 1080 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM260Q9NX78 707 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PHACTR2O75167 634 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SLC51AQ86UW1 340 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 DEF6Q9H4E7 631 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 USP17L5A8MUK1 530 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PDIA5Q14554 519 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 RAD54LQ92698 747 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 EPHB6O15197 1021 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SLC37A4O43826 429 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PDHBP11177 359 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf54Q08AI8 447 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PSMD2Q13200 908 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CREG2Q8IUH2 290 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SLF2Q8IX21 1173 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CD209Q9NNX6 404 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 AKR1B10O60218 316 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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