RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 CEP57Q86XR8 500 aa27.33■■□□□ 1.97
PKDCC-201ENST00000294964 CEP120Q8N960 986 aa27.33■■□□□ 1.97
PKDCC-201ENST00000294964 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.33■■□□□ 1.97
PKDCC-201ENST00000294964 KRT86O43790 486 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 KRT14P02533 472 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 PDHBP11177 359 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 KDM7AQ6ZMT4 941 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 EGFL6Q8IUX8 553 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SLC24A3Q9HC58 644 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 ANO9A1A5B4 782 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 PTGDRQ13258 359 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SLC15A2Q16348 729 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 WDR59Q6PJI9 974 aa27.32■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SEC24CP53992 1094 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 APBA1Q02410 837 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 UBXN1Q04323 297 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 FKBP15Q5T1M5 1219 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 GSDMAQ96QA5 445 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 DUSP10Q9Y6W6 482 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 LAMB2P55268 1798 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 MCM7P33993 719 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CDR1P51861 262 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 PTGISQ16647 500 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 TCP11X2Q5H9J9 407 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CREG2Q8IUH2 290 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 KCNJ18B7U540 433 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 KCNJ12Q14500 433 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CRYMQ14894 314 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 EMBQ6PCB8 327 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CCT8L2Q96SF2 557 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJC7Q99615 494 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CASZ1Q86V15 1759 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 TSPY2A6NKD2 308 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 KRT83P78385 493 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SNCBQ16143 134 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP14Q86W24 1093 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 FAM228AQ86W67 206 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SETDB2Q96T68 719 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 MTA3Q9BTC8 594 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.3■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1R37O75864 691 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP5P59047 1200 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 NFIXQ14938 502 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 TTC38Q5R3I4 469 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF662Q6ZS27 426 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP3Q96P20 1036 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 RUBCNQ92622 972 aa27.29■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 MACROD2A1Z1Q3 448 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SPAG1Q07617 926 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 PARP9Q8IXQ6 854 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CAVIN3Q969G5 261 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 RCAN1P53805 252 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 GRIK5Q16478 980 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 FRMD3A2A2Y4 597 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 IL17AQ16552 155 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 C6orf89Q6UWU4 347 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SPATA4Q8NEY3 305 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 TNFRSF25Q93038 417 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 STK32BQ9NY57 414 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CYB5D1Q6P9G0 228 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC114Q96M63 670 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 SNX12Q9UMY4 172 aa27.27■■□□□ 1.96
PKDCC-201ENST00000294964 ERCC3P19447 782 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 SGSM3Q96HU1 749 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 STIM2Q9P246 746 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GUL6 1792 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF233A6NK53 670 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 GGA2Q9UJY4 613 aa27.26■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 NR1D1P20393 614 aa27.25■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 FMNL3Q8IVF7 1028 aa27.25■■□□□ 1.95
PKDCC-201ENST00000294964 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms