RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cep70Q6IQY5 616 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc20a2Q80UP8 656 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adcy3Q8VHH7 1145 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ribc1Q9D0B8 379 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lig1P37913 916 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gfpt1P47856 697 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gdf10P97737 476 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pla2g4eQ50L42 875 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krt87Q6IMF0 495 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp15Q8R5H1 981 aa24.27■■□□□ 1.48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcb4P21440 1276 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bend4P86174 541 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krit1Q6S5J6 736 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem132aQ922P8 1018 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hps4Q99KG7 671 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smtnl1Q99LM3 459 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tlr13Q6R5N8 991 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DaglaQ6WQJ1 1044 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Haus4Q8BFT2 363 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc96Q9CR92 584 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krt34Q9D646 392 aa24.26■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map7d1A2AJI0 846 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RargP18911 458 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppm1eQ80TL0 749 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spata16Q8C636 571 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf287Q9EQB9 759 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm7168A0AUV4 508 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Capza3P70190 299 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc157Q5SPX1 718 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif3j2Q66JS6 263 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kbtbd4Q8R179 534 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kremen1Q99N43 473 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ubxn6Q99PL6 442 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Jag1Q9QXX0 1218 aa24.25■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm4985A2ALC6 410 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r68L7N2B3 851 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pla2g4aP47713 748 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exoc8Q6PGF7 716 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd24Q80VM7 985 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Onecut3Q8K557 490 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tjap1Q9DCD5 539 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa24.24■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc32G3XA59 663 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam178bQ24JP3 464 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ica1lQ3TY65 431 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Shc3Q61120 474 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RragaQ80X95 313 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AacsQ9D2R0 672 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Peg12Q9WVA7 283 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Apol6B7ZC55 329 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MybP06876 636 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm7aQ3UWM4 940 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trpc6Q61143 930 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BcrQ6PAJ1 1270 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Armcx3Q8BHS6 379 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psmd2Q8VDM4 908 aa24.23■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Grem2O88273 168 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd37Q61470 281 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clca4aQ6Q473 924 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Erlin1Q91X78 346 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc105Q9D4K7 499 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Galntl5Q9D4M9 431 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc83Q9D4V3 305 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myo1cQ9WTI7 1063 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Otud7bB2RUR8 840 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klra1P20937 262 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GscQ02591 256 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 EregQ61521 162 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adcy2Q80TL1 1090 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bbs9Q811G0 885 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc7aQ8BGB2 858 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtmr4Q91XS1 1190 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Calr3Q9D9Q6 380 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inpp4aQ9EPW0 939 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sertad1Q9JL10 236 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klrc1Q9Z202 244 aa24.22■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tsg101Q61187 391 aa24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Amhr2Q8K592 568 aa24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bcl11bQ99PV8 884 aa24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scn9aQ62205 1984 aa24.21■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcnma1Q08460 1209 aa24.2■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd13aQ80UP5 588 aa24.2■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eno4Q8C042 619 aa24.2■■□□□ 1.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc41Q8K1C9 807 aa24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms