Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Calr3Q9D9Q6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Calr3Q9D9Q6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Calr3Q9D9Q6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Calr3Q9D9Q6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Calr3Q9D9Q6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Calr3Q9D9Q6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Calr3Q9D9Q6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Calr3Q9D9Q6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Calr3Q9D9Q6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Calr3Q9D9Q6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Calr3Q9D9Q6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Calr3Q9D9Q6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Calr3Q9D9Q6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Calr3Q9D9Q6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Calr3Q9D9Q6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Calr3Q9D9Q6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Calr3Q9D9Q6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Calr3Q9D9Q6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Calr3Q9D9Q6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Calr3Q9D9Q6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Calr3Q9D9Q6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Calr3Q9D9Q6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Calr3Q9D9Q6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Calr3Q9D9Q6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Calr3Q9D9Q6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Calr3Q9D9Q6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Calr3Q9D9Q6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Calr3Q9D9Q6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Calr3Q9D9Q6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Calr3Q9D9Q6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Calr3Q9D9Q6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Calr3Q9D9Q6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Calr3Q9D9Q6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Calr3Q9D9Q6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Calr3Q9D9Q6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Calr3Q9D9Q6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Calr3Q9D9Q6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Calr3Q9D9Q6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Calr3Q9D9Q6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Calr3Q9D9Q6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Calr3Q9D9Q6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Calr3Q9D9Q6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Calr3Q9D9Q6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Calr3Q9D9Q6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Calr3Q9D9Q6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Calr3Q9D9Q6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Calr3Q9D9Q6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Calr3Q9D9Q6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Calr3Q9D9Q6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Calr3Q9D9Q6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Calr3Q9D9Q6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Calr3Q9D9Q6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Calr3Q9D9Q6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Calr3Q9D9Q6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Calr3Q9D9Q6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Calr3Q9D9Q6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Calr3Q9D9Q6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Calr3Q9D9Q6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Calr3Q9D9Q6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Calr3Q9D9Q6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Calr3Q9D9Q6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Calr3Q9D9Q6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Calr3Q9D9Q6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Calr3Q9D9Q6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Calr3Q9D9Q6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Calr3Q9D9Q6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Calr3Q9D9Q6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Calr3Q9D9Q6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Calr3Q9D9Q6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Calr3Q9D9Q6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Calr3Q9D9Q6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Calr3Q9D9Q6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,2
Calr3Q9D9Q6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Calr3Q9D9Q6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Calr3Q9D9Q6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Calr3Q9D9Q6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Calr3Q9D9Q6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Calr3Q9D9Q6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Calr3Q9D9Q6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Calr3Q9D9Q6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Calr3Q9D9Q6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Calr3Q9D9Q6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Calr3Q9D9Q6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Calr3Q9D9Q6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Calr3Q9D9Q6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Calr3Q9D9Q6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Calr3Q9D9Q6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Calr3Q9D9Q6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Calr3Q9D9Q6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Calr3Q9D9Q6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Calr3Q9D9Q6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms