Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Kcnma1Q08460 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Kcnma1Q08460 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Kcnma1Q08460 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kcnma1Q08460 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Kcnma1Q08460 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Kcnma1Q08460 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kcnma1Q08460 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Kcnma1Q08460 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kcnma1Q08460 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kcnma1Q08460 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kcnma1Q08460 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kcnma1Q08460 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Kcnma1Q08460 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Kcnma1Q08460 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Kcnma1Q08460 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kcnma1Q08460 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Kcnma1Q08460 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Kcnma1Q08460 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kcnma1Q08460 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kcnma1Q08460 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kcnma1Q08460 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Kcnma1Q08460 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kcnma1Q08460 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kcnma1Q08460 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kcnma1Q08460 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kcnma1Q08460 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Kcnma1Q08460 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Kcnma1Q08460 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kcnma1Q08460 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kcnma1Q08460 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kcnma1Q08460 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kcnma1Q08460 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Kcnma1Q08460 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kcnma1Q08460 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kcnma1Q08460 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kcnma1Q08460 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kcnma1Q08460 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kcnma1Q08460 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kcnma1Q08460 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kcnma1Q08460 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kcnma1Q08460 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Kcnma1Q08460 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kcnma1Q08460 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kcnma1Q08460 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kcnma1Q08460 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kcnma1Q08460 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kcnma1Q08460 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kcnma1Q08460 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kcnma1Q08460 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kcnma1Q08460 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kcnma1Q08460 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Kcnma1Q08460 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kcnma1Q08460 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Kcnma1Q08460 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kcnma1Q08460 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kcnma1Q08460 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kcnma1Q08460 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kcnma1Q08460 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kcnma1Q08460 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kcnma1Q08460 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kcnma1Q08460 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kcnma1Q08460 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kcnma1Q08460 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kcnma1Q08460 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kcnma1Q08460 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Kcnma1Q08460 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Kcnma1Q08460 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Kcnma1Q08460 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Kcnma1Q08460 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Kcnma1Q08460 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Kcnma1Q08460 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Kcnma1Q08460 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Kcnma1Q08460 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Kcnma1Q08460 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Kcnma1Q08460 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kcnma1Q08460 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Kcnma1Q08460 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kcnma1Q08460 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kcnma1Q08460 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Kcnma1Q08460 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Kcnma1Q08460 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Kcnma1Q08460 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Kcnma1Q08460 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Kcnma1Q08460 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Kcnma1Q08460 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Kcnma1Q08460 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Kcnma1Q08460 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kcnma1Q08460 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Kcnma1Q08460 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Kcnma1Q08460 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms