Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,1■■■■■ 4,33
Kcnma1Q08460 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Kcnma1Q08460 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Kcnma1Q08460 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Kcnma1Q08460 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,01■■■■□ 3,52
Kcnma1Q08460 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Kcnma1Q08460 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Kcnma1Q08460 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Kcnma1Q08460 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Kcnma1Q08460 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kcnma1Q08460 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Kcnma1Q08460 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Kcnma1Q08460 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
Kcnma1Q08460 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Kcnma1Q08460 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,96■■■■□ 3,19
Kcnma1Q08460 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Kcnma1Q08460 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Kcnma1Q08460 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Kcnma1Q08460 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Kcnma1Q08460 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Kcnma1Q08460 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Kcnma1Q08460 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Kcnma1Q08460 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kcnma1Q08460 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Kcnma1Q08460 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Kcnma1Q08460 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kcnma1Q08460 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Kcnma1Q08460 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Kcnma1Q08460 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Kcnma1Q08460 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Kcnma1Q08460 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Kcnma1Q08460 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Kcnma1Q08460 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Kcnma1Q08460 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Kcnma1Q08460 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Kcnma1Q08460 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Kcnma1Q08460 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Kcnma1Q08460 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Kcnma1Q08460 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Kcnma1Q08460 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Kcnma1Q08460 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Kcnma1Q08460 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Kcnma1Q08460 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Kcnma1Q08460 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Kcnma1Q08460 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Kcnma1Q08460 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Kcnma1Q08460 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Kcnma1Q08460 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Kcnma1Q08460 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Kcnma1Q08460 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Kcnma1Q08460 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Kcnma1Q08460 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Kcnma1Q08460 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Kcnma1Q08460 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
Kcnma1Q08460 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Kcnma1Q08460 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Kcnma1Q08460 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Kcnma1Q08460 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Kcnma1Q08460 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Kcnma1Q08460 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Kcnma1Q08460 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Kcnma1Q08460 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Kcnma1Q08460 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Kcnma1Q08460 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Kcnma1Q08460 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Kcnma1Q08460 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Kcnma1Q08460 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Kcnma1Q08460 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Kcnma1Q08460 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Kcnma1Q08460 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Kcnma1Q08460 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Kcnma1Q08460 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Kcnma1Q08460 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Kcnma1Q08460 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Kcnma1Q08460 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Kcnma1Q08460 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Kcnma1Q08460 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Kcnma1Q08460 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Kcnma1Q08460 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Kcnma1Q08460 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Kcnma1Q08460 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Kcnma1Q08460 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Kcnma1Q08460 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Kcnma1Q08460 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Kcnma1Q08460 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Kcnma1Q08460 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Kcnma1Q08460 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Kcnma1Q08460 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Kcnma1Q08460 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Kcnma1Q08460 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Kcnma1Q08460 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms