RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C ENV9Q08651 330 aa25.55■■□□□ 1.68
YKL036CYKL036C YRF1-2P40105 1681 aa25.48■■□□□ 1.67
YKL036CYKL036C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
YKL036CYKL036C PPH3P32345 308 aa25.43■■□□□ 1.66
YKL036CYKL036C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
YKL036CYKL036C TY4B-HP0C2J7 1802 aa25.41■■□□□ 1.66
YKL036CYKL036C TY4B-JP47024 1803 aa25.41■■□□□ 1.66
YKL036CYKL036C YMR074CQ04773 145 aa25.4■■□□□ 1.66
YKL036CYKL036C SPE2P21182 396 aa25.37■■□□□ 1.65
YKL036CYKL036C KIP3P53086 805 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
YKL036CYKL036C PSK1P31374 1356 aa25.32■■□□□ 1.64
YKL036CYKL036C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
YKL036CYKL036C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
YKL036CYKL036C PRI1P10363 409 aa25.21■■□□□ 1.63
YKL036CYKL036C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
YKL036CYKL036C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
YKL036CYKL036C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
YKL036CYKL036C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
YKL036CYKL036C LEU3P08638 886 aa25.09■■□□□ 1.61
YKL036CYKL036C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
YKL036CYKL036C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
YKL036CYKL036C SCT1P32784 759 aa25.06■■□□□ 1.6
YKL036CYKL036C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
YKL036CYKL036C URB1P34241 1764 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
YKL036CYKL036C CSE4P36012 229 aa25.03■■□□□ 1.6
YKL036CYKL036C PRP43P53131 767 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
YKL036CYKL036C TCB1Q12466 1186 aa25.01■■□□□ 1.59
YKL036CYKL036C IES2P40154 320 aa24.99■■□□□ 1.59
YKL036CYKL036C RSF2P46974 1380 aa24.96■■□□□ 1.59
YKL036CYKL036C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
YKL036CYKL036C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
YKL036CYKL036C SLM3Q12093 417 aa24.96■■□□□ 1.59
YKL036CYKL036C UBP1P25037 809 aa24.92■■□□□ 1.58
YKL036CYKL036C FKS3Q04952 1785 aa24.9■■□□□ 1.58
YKL036CYKL036C DOT5P40553 215 aa24.89■■□□□ 1.58
YKL036CYKL036C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
YKL036CYKL036C RPN11P43588 306 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
YKL036CYKL036C YML133CQ03099 1374 aa24.85■■□□□ 1.57
YKL036CYKL036C YLL067CQ07888 1374 aa24.85■■□□□ 1.57
YKL036CYKL036C YLL066CQ99208 1374 aa24.85■■□□□ 1.57
YKL036CYKL036C YRF1-3P0CX14 1859 aa24.83■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C YRF1-7P0CX15 1859 aa24.83■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C YRF1-6P53819 1859 aa24.83■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C EDE1P34216 1381 aa24.8■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C YIL177CP40434 1758 aa24.8■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C YJL225CP40889 1758 aa24.8■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C ENP1P38333 483 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
YKL036CYKL036C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C XKS1P42826 600 aa24.75■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C APC1P53886 1748 aa24.72■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C FKH1P40466 484 aa24.72■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C YKL133CP36066 463 aa24.71■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C YJL181WP46987 611 aa24.71■■□□□ 1.55
YKL036CYKL036C LAM6Q08001 693 aa24.66■■□□□ 1.54
YKL036CYKL036C DPS1P04802 557 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
YKL036CYKL036C PDI1P17967 522 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
YKL036CYKL036C RTF1P53064 558 aa24.64■■□□□ 1.54
YKL036CYKL036C YBL086CP38177 466 aa24.63■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C NPR2P39923 615 aa24.63■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C PRP40P33203 583 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C GAS4Q08271 471 aa24.62■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C COBP00163 385 aa24.59■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C RTG3P38165 486 aa24.58■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C GTT3P39996 337 aa24.58■■□□□ 1.53
YKL036CYKL036C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
YKL036CYKL036C YRF1-4O13559 1382 aa24.54■■□□□ 1.52
YKL036CYKL036C UGA2P38067 497 aa24.54■■□□□ 1.52
YKL036CYKL036C YKR075CP36155 307 aa24.51■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C ALD2P47771 506 aa24.5■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C MEC3Q02574 474 aa24.5■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C SNF2P22082 1703 aa24.49■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C TAP42Q04372 366 aa24.48■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C SIR4P11978 1358 aa24.47■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C GRX4P32642 244 aa24.47■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C RCR1P38212 213 aa24.46■■□□□ 1.51
YKL036CYKL036C MHP1P43638 1398 aa24.44■■□□□ 1.5
YKL036CYKL036C AUS1Q08409 1394 aa24.43■■□□□ 1.5
YKL036CYKL036C SSA2P10592 639 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
YKL036CYKL036C POL5P39985 1022 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
YKL036CYKL036C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
YKL036CYKL036C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
YKL036CYKL036C PDS5Q04264 1277 aa24.39■■□□□ 1.49
YKL036CYKL036C CTH1P47976 325 aa24.37■■□□□ 1.49
YKL036CYKL036C ADE16P54113 591 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
YKL036CYKL036C HIM1Q06674 414 aa24.36■■□□□ 1.49
YKL036CYKL036C ATG13Q06628 738 aa24.27■■□□□ 1.48
YKL036CYKL036C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
YKL036CYKL036C SPT7P35177 1332 aa24.26■■□□□ 1.47
YKL036CYKL036C RIM15P43565 1770 aa24.26■■□□□ 1.47
YKL036CYKL036C KAR2P16474 682 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
YKL036CYKL036C MSB4Q12317 492 aa24.21■■□□□ 1.47
YKL036CYKL036C BDF1P35817 686 aa24.2■■□□□ 1.46
YKL036CYKL036C INP54Q08227 384 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
YKL036CYKL036C ALD3P54114 506 aa24.14■■□□□ 1.45
YKL036CYKL036C OSM1P21375 501 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
YKL036CYKL036C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data24.13■■□□□ 1.45not detected
YKL036CYKL036C RPG1P38249 964 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
YKL036CYKL036C GRX1P25373 110 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms