RNA–Protein interactions for RNA: YHR132W-A

IGO2, Transcript of Protein required for initiation of G0 program, yeast

Gene IGO2, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IGO2	YHR132W-A	YBT1	P32386	1661 aa		6.2	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	TY3B-G	Q99315	1547 aa		6.2	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	MIF2	P35201	549 aa		6.2	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	PDR10	P51533	1564 aa		6.19	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	IQG1	Q12280	1495 aa		6.18	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	XDJ1	P39102	459 aa		6.18	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	RTT106	P40161	455 aa		6.17	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	YDL129W	Q07555	291 aa		6.16	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	BUD3	P25558	1636 aa		6.15	□□□□□ -1.42
IGO2	YHR132W-A	YDR344C	Q05510	147 aa		6.14	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	VRP1	P37370	817 aa		6.13	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	SAM3	Q08986	587 aa		6.13	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	TRM3	Q07527	1436 aa		6.13	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	SRC1	Q03707	834 aa		6.12	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	IFH1	P39520	1085 aa		6.11	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	YOR093C	Q12275	1648 aa		6.1	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	MRM1	P25270	412 aa		6.1	□□□□□ -1.43
IGO2	YHR132W-A	CAT8	P39113	1433 aa		6.08	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	YSP2	Q06681	1438 aa		6.08	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	JIP4	Q03361	876 aa		6.08	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	TAF7	Q05021	590 aa		6.08	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	YFR006W	P43590	535 aa		6.06	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	VPS29	P38759	282 aa		6.05	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	DNF3	Q12674	1656 aa		6.04	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
IGO2	YHR132W-A	YLR271W	Q06152	274 aa		6.04	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	STS1	P38637	319 aa		6.03	□□□□□ -1.44
IGO2	YHR132W-A	CKB1	P43639	278 aa		6	□□□□□ -1.45
IGO2	YHR132W-A	BNR1	P40450	1375 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IGO2	YHR132W-A	USO1	P25386	1790 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IGO2	YHR132W-A	PTC4	P38089	393 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	SRB8	P25648	1427 aa		5.95	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	YEL023C	P39992	682 aa		5.94	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	VMR1	P38735	1592 aa		5.93	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	YAP3	P38749	330 aa		5.93	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	GYP5	Q12344	894 aa		5.93	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	HTA2	P04912	132 aa		5.92	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	DCW1	P36091	449 aa		5.92	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	IML1	P47170	1584 aa		5.9	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
IGO2	YHR132W-A	SSM4	P40318	1319 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	MAK10	Q02197	733 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	PML39	Q03760	334 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	RTG3	P38165	486 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	IPL1	P38991	367 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
IGO2	YHR132W-A	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	PDR11	P40550	1411 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	ARH1	P48360	493 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	GCN2	P15442	1659 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	RCR1	P38212	213 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IGO2	YHR132W-A	CST9	Q06032	482 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	MID1	P41821	548 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	RAS1	P01119	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	NUP192	P47054	1683 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	SPT23	P35210	1082 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	THI12	P42883	340 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	THI5	P43534	340 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	THI11	P47183	340 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	THI13	Q07748	340 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IGO2	YHR132W-A	KRE5	P22023	1365 aa		5.69	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	NST1	P53935	1240 aa		5.69	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.69	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	RAV1	P47104	1357 aa		5.67	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	BCK1	Q01389	1478 aa		5.67	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	YPL062W	Q02781	134 aa		5.67	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
IGO2	YHR132W-A	RAD9	P14737	1309 aa		5.64	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	BNI4	P53858	892 aa		5.63	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	RIA1	P53893	1110 aa		5.63	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	HAP5	Q02516	242 aa		5.63	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	RTC1	Q08281	1341 aa		5.62	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	PEX29	Q03370	554 aa		5.61	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	CAB1	Q04430	367 aa		5.61	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	TRK1	P12685	1235 aa		5.59	□□□□□ -1.51
IGO2	YHR132W-A	SOL3	P38858	249 aa		5.59	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.2 ms