RNA–Protein interactions for RNA: YGL028C

SCW11, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW11, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW11	YGL028C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SCW11	YGL028C	BDP1	P46678	594 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SCW11	YGL028C	SEC2	P17065	759 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SCW11	YGL028C	RRN7	P40992	514 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SCW11	YGL028C	YDR444W	Q04093	687 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SCW11	YGL028C	IFH1	P39520	1085 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SCW11	YGL028C	HED1	Q03937	162 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SCW11	YGL028C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	ORC6	P38826	435 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	ASH1	P34233	588 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	MET32	Q12041	191 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SCW11	YGL028C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	AFT1	P22149	690 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	HST3	P53687	447 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	YPR109W	Q06104	294 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	KEX2	P13134	814 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	ERF2	Q06551	359 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SCW11	YGL028C	RGR1	P19263	1082 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	PUS5	Q06244	254 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	MOD5	P07884	428 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	YJR115W	P47152	169 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	MTC5	Q03897	1148 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	YPR148C	Q06523	435 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	COX6	P00427	148 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	CAF120	P53836	1060 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SCW11	YGL028C	TUB4	P53378	473 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	AGE1	Q04412	482 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	ACO2	P39533	789 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	VPS70	P47161	811 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	TRK2	P28584	889 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	YGR035C	P53222	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCW11	YGL028C	OPT2	Q06593	877 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	YLR346C	Q06139	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	UGA3	P26370	528 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	RTF1	P53064	558 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	KXD1	P53158	218 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	SRF1	Q12516	437 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	CLB5	P30283	435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	YNL115C	P53925	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	TPD3	P31383	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	YIR007W	P40566	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	HXT10	P43581	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	HPF1	Q05164	967 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW11	YGL028C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	SCW11	P53189	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	NUP85	P46673	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	KIP2	P28743	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	MIP1	P15801	1254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	SIT4	P20604	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW11	YGL028C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	PBS2	P08018	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	IXR1	P33417	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	ICP55	P40051	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	RTT106	P40161	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	ALR1	Q08269	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	TEA1	P47988	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	NIS1	P53939	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	SLY41	P22215	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	RPA14	P50106	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	LSC2	P53312	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	MAM3	Q12296	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW11	YGL028C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	TBF1	Q02457	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	ARG82	P07250	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	CKB1	P43639	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	AAD14	P42884	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	DPH6	Q12429	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	ROG3	P43602	733 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	PHM7	Q12252	991 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	IES2	P40154	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	PUS6	P53294	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SCW11	YGL028C	YJR098C	P47139	656 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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