RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-231ENST00000552222 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-231ENST00000552222 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-231ENST00000552222 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.33■■□□□ 1.32
CS-231ENST00000552222 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-231ENST00000552222 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CS-231ENST00000552222 ATP10AO60312 1499 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-231ENST00000552222 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-231ENST00000552222 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 AFAP1Q8N556 730 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 PLCH2O75038 1416 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-231ENST00000552222 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-231ENST00000552222 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CS-231ENST00000552222 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-231ENST00000552222 PTPRTO14522 1441 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-231ENST00000552222 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-231ENST00000552222 C3P01024 1663 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-231ENST00000552222 KIF14Q15058 1648 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-231ENST00000552222 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.08■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 NCOA1Q15788 1441 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 ABCA6Q8N139 1617 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-231ENST00000552222 KDM5CP41229 1560 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-231ENST00000552222 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-231ENST00000552222 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23■■□□□ 1.27
CS-231ENST00000552222 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-231ENST00000552222 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CS-231ENST00000552222 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-231ENST00000552222 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 HSPA1LP34931 641 aa22.91■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 REREQ9P2R6 1566 aa22.91■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.91■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.89■■□□□ 1.26
CS-231ENST00000552222 PIP4K2BP78356 416 aa22.89■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 AGLP35573 1532 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 ZMYM3Q14202 1370 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 ABCC1P33527 1531 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-231ENST00000552222 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 FMN1Q68DA7 1419 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 NPATQ14207 1427 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 EEA1Q15075 1411 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 CLIP1P30622 1438 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-231ENST00000552222 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 PREX2Q70Z35 1606 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 PTPRKQ15262 1439 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 PKD2Q13563 968 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 GGT6Q6P531 493 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 MROH2AA6NES4 1674 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-231ENST00000552222 PLA2R1Q13018 1463 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 ALKQ9UM73 1620 aa22.64■■□□□ 1.22
CS-231ENST00000552222 TOM1O60784 492 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 A2MP01023 1474 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 ATP7AQ04656 1500 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 PLXNC1O60486 1568 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CS-231ENST00000552222 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.58■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-231ENST00000552222 CPS1P31327 1500 aa22.53■■□□□ 1.2
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