RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHD1O14646 1710 aa13.85□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEMA6NI47 508 aa13.85□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.83□□□□□ -0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEGQ6S5H5 508 aa13.82□□□□□ -0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 TOPBP1Q92547 1522 aa13.81□□□□□ -0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCC8Q09428 1581 aa13.8□□□□□ -0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
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MSC-AS1-202ENST00000512290 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRDM2Q13029 1718 aa13.71□□□□□ -0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.7□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 SOGA1O94964 1423 aa13.69□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.68□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.67□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYNJ1O43426 1573 aa13.67□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.67□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.67□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.67□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.66□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.63□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.63□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 G3V3G9 751 aa13.62□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.61□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 SNPHO15079 494 aa13.6□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 ST18O60284 1047 aa13.6□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.6□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.56□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.56□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYNJ2O15056 1496 aa13.55□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 GRIN2BQ13224 1484 aa13.55□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.54□□□□□ -0.24
MSC-AS1-202ENST00000512290 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.51□□□□□ -0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.49□□□□□ -0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 SOX12O15370 315 aa13.48□□□□□ -0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.46□□□□□ -0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 WDR97A6NE52 1622 aa13.45□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.42□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.42□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 STK24Q9Y6E0 443 aa13.42□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 MARVELD3Q96A59 401 aa13.41□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.4□□□□□ -0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 PKD2Q13563 968 aa13.39□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 STK25O00506 426 aa13.38□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 MICALL2Q8IY33 904 aa13.37□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 JPH4Q96JJ6 628 aa13.37□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.37□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 PBRM1Q86U86 1689 aa13.37□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 CEP170Q5SW79 1584 aa13.37□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 NLRP6P59044 892 aa13.35□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 GRIN2AQ12879 1464 aa13.35□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 CUX1P39880 1505 aa13.34□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 RGL2O15211 777 aa13.34□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 EMP3P54852 163 aa13.34□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.34□□□□□ -0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM6BO15054 1643 aa13.33□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 TSPOAP1O95153 1857 aa13.33□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.3□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 DOK7Q18PE1 504 aa13.28□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 FBXO41Q8TF61 875 aa13.28□□□□□ -0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.27□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUP160Q12769 1436 aa13.27□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.26□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.26□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 MFRPQ9BY79 579 aa13.26□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.25□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM205CA6NFA0 338 aa13.25□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 RIMBP2O15034 1052 aa13.23□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADGRL1O94910 1474 aa13.23□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.22□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.22□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.22□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 SHROOM2Q13796 1616 aa13.21□□□□□ -0.29
MSC-AS1-202ENST00000512290 DIP2BQ9P265 1576 aa13.2□□□□□ -0.3
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAPKBP1O60336 1514 aa13.19□□□□□ -0.3
MSC-AS1-202ENST00000512290 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
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