RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.23■■■□□ 2.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXD1Q16676 465 aa23.5■■□□□ 1.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.65■■□□□ 1.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.08■■□□□ 1.13
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADRA2BP18089 450 aa22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-202ENST00000512290 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
MSC-AS1-202ENST00000512290 MSH5O43196 834 aa21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEDQ86YR6 584 aa21.2■□□□□ 0.98
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.87■□□□□ 0.77
MSC-AS1-202ENST00000512290 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.47■□□□□ 0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.31■□□□□ 0.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
MSC-AS1-202ENST00000512290 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
MSC-AS1-202ENST00000512290 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF39Q9H2S5 420 aa18.73■□□□□ 0.59
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNA4P22459 653 aa18.62■□□□□ 0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.61■□□□□ 0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
MSC-AS1-202ENST00000512290 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
MSC-AS1-202ENST00000512290 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.4■□□□□ 0.54
MSC-AS1-202ENST00000512290 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC4A2P04920 1241 aa17.95■□□□□ 0.46
MSC-AS1-202ENST00000512290 CAPN15O75808 1086 aa17.79■□□□□ 0.44
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
MSC-AS1-202ENST00000512290 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
MSC-AS1-202ENST00000512290 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
MSC-AS1-202ENST00000512290 APLP2Q06481 763 aa17.63■□□□□ 0.41
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
MSC-AS1-202ENST00000512290 DSG3P32926 999 aa17.59■□□□□ 0.41
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
MSC-AS1-202ENST00000512290 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
MSC-AS1-202ENST00000512290 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCC9O60706 1549 aa17.42■□□□□ 0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCB7O75027 752 aa17.38■□□□□ 0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.33■□□□□ 0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 POLA2Q14181 598 aa17.08■□□□□ 0.32
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZBTB22O15209 634 aa17.07■□□□□ 0.32
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
MSC-AS1-202ENST00000512290 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.78■□□□□ 0.28
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEHQ6S545 545 aa16.66■□□□□ 0.26
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.64■□□□□ 0.25
MSC-AS1-202ENST00000512290 OSCARQ8IYS5 282 aa16.5■□□□□ 0.23
MSC-AS1-202ENST00000512290 AKT1S1Q96B36 256 aa16.45■□□□□ 0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.44■□□□□ 0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 FBLN2P98095 1184 aa16.41■□□□□ 0.22
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.38■□□□□ 0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.36■□□□□ 0.21
MSC-AS1-202ENST00000512290 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
MSC-AS1-202ENST00000512290 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.25■□□□□ 0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.25■□□□□ 0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.21■□□□□ 0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE6P0CI01 402 aa16.21■□□□□ 0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.21■□□□□ 0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 PITPNM1O00562 1244 aa16.1■□□□□ 0.17
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
MSC-AS1-202ENST00000512290 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.02■□□□□ 0.16
MSC-AS1-202ENST00000512290 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-202ENST00000512290 NACADO15069 1562 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-202ENST00000512290 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-202ENST00000512290 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-202ENST00000512290 HAX1O00165 279 aa15.76■□□□□ 0.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.76■□□□□ 0.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.73■□□□□ 0.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.68■□□□□ 0.1
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR29P0C7W0 189 aa15.68■□□□□ 0.1
MSC-AS1-202ENST00000512290 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
MSC-AS1-202ENST00000512290 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.61■□□□□ 0.09
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.58■□□□□ 0.08
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHADLQ6NUI6 762 aa15.57■□□□□ 0.08
MSC-AS1-202ENST00000512290 EVX2Q03828 476 aa15.5■□□□□ 0.07
MSC-AS1-202ENST00000512290 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.45■□□□□ 0.06
MSC-AS1-202ENST00000512290 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.44■□□□□ 0.06
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
MSC-AS1-202ENST00000512290 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.41■□□□□ 0.06
MSC-AS1-202ENST00000512290 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.39■□□□□ 0.05
MSC-AS1-202ENST00000512290 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
MSC-AS1-202ENST00000512290 SCRIBQ14160 1630 aa15.28■□□□□ 0.04
MSC-AS1-202ENST00000512290 CREBZFQ9NS37 354 aa15.26■□□□□ 0.03
MSC-AS1-202ENST00000512290 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM41Q8WV44 630 aa15.19■□□□□ 0.02
MSC-AS1-202ENST00000512290 GABBR2O75899 941 aa15.18■□□□□ 0.02
MSC-AS1-202ENST00000512290 CUX2O14529 1486 aa15.15■□□□□ 0.02
MSC-AS1-202ENST00000512290 ERCC6Q03468 1493 aa15.15■□□□□ 0.02
MSC-AS1-202ENST00000512290 PROM2Q8N271 834 aa15.13■□□□□ 0.01
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