RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.07■■□□□ 1.44
PREB-208ENST00000468045 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.04■■□□□ 1.44
PREB-208ENST00000468045 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PREB-208ENST00000468045 NEFMP07197 916 aa23.99■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 PRDM2Q13029 1718 aa23.99■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.98■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.98■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.98■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 HECW1Q76N89 1606 aa23.97■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PREB-208ENST00000468045 SKAP1Q86WV1 359 aa23.95■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 GRIN2BQ13224 1484 aa23.95■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.94■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.93■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 TMC1Q8TDI8 760 aa23.92■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.92■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 PDE4AP27815 886 aa23.91■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.9■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.9■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.89■■□□□ 1.42
PREB-208ENST00000468045 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.89■■□□□ 1.41
PREB-208ENST00000468045 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.89■■□□□ 1.41
PREB-208ENST00000468045 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PREB-208ENST00000468045 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PREB-208ENST00000468045 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PREB-208ENST00000468045 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PREB-208ENST00000468045 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 ARHGEF11O15085 1522 aa23.82■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 BACH2Q9BYV9 841 aa23.82■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 USP47Q96K76 1375 aa23.82■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.82■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.82■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.8■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 SAMD9Q5K651 1589 aa23.8■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 TOPBP1Q92547 1522 aa23.8■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 CUL7Q14999 1698 aa23.79■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.79■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 PLIN1O60240 522 aa23.79■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 SLC4A3P48751 1232 aa23.79■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.78■■□□□ 1.4
PREB-208ENST00000468045 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.75■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.75■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.72■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 NESP48681 1621 aa23.71■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 MIA2Q96PC5 1412 aa23.71■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 USP35Q9P2H5 1018 aa23.71■■□□□ 1.39
PREB-208ENST00000468045 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.69■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 DAPK1P53355 1430 aa23.68■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.67■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 ABCC5O15440 1437 aa23.67■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.65■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.64■■□□□ 1.38
PREB-208ENST00000468045 PKD2Q13563 968 aa23.64■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 MS4A1P11836 297 aa23.63■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 NFKBIBQ15653 356 aa23.63■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 GSE1Q14687 1217 aa23.63■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 CRBNQ96SW2 442 aa23.63■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 KIF15Q9NS87 1388 aa23.62■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 PZPP20742 1482 aa23.61■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.6■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.58■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 ROCK1Q13464 1354 aa23.58■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 MBD5Q9P267 1494 aa23.58■■□□□ 1.37
PREB-208ENST00000468045 KDM5CP41229 1560 aa23.58■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 RALBP1Q15311 655 aa23.53■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.53■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.52■■□□□ 1.36
PREB-208ENST00000468045 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.5■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 NLRP13Q86W25 1043 aa23.48■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.48■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 KIF14Q15058 1648 aa23.47■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 PDE3BQ13370 1112 aa23.46■■□□□ 1.35
PREB-208ENST00000468045 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PREB-208ENST00000468045 WDR62O43379 1518 aa23.43■■□□□ 1.34
PREB-208ENST00000468045 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PREB-208ENST00000468045 RGS3P49796 1198 aa23.41■■□□□ 1.34
PREB-208ENST00000468045 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.41■■□□□ 1.34
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