RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442396.6

ZNF839-202, Transcript of zinc finger protein 839, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene ZNF839, Length 2,987 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 KDM6BO15054 1643 aa25.15■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.13■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.1■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 TMC1Q8TDI8 760 aa25.09■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.08■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 HECW1Q76N89 1606 aa25.08■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 NESP48681 1621 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 PRDM2Q13029 1718 aa25.06■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 PDE4AP27815 886 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 GRIN2BQ13224 1484 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.97■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 SKAP1Q86WV1 359 aa24.96■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.96■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 BACH2Q9BYV9 841 aa24.93■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 USP47Q96K76 1375 aa24.93■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.92■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.91■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 USP35Q9P2H5 1018 aa24.9■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 CUL7Q14999 1698 aa24.9■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.89■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 ARHGEF11O15085 1522 aa24.87■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 SLC4A3P48751 1232 aa24.87■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 TOPBP1Q92547 1522 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 SAMD9Q5K651 1589 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 PLIN1O60240 522 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 MIA2Q96PC5 1412 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.83■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.82■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 MS4A1P11836 297 aa24.79■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 GSE1Q14687 1217 aa24.78■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.77■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 DAPK1P53355 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 NFKBIBQ15653 356 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 KIF15Q9NS87 1388 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.73■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 PKD2Q13563 968 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 CRBNQ96SW2 442 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 ABCC5O15440 1437 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 ROCK1Q13464 1354 aa24.68■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 RALBP1Q15311 655 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 PZPP20742 1482 aa24.65■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 KDM5CP41229 1560 aa24.63■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 MBD5Q9P267 1494 aa24.62■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.62■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 PDE3BQ13370 1112 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 NLRP13Q86W25 1043 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.6■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.57■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 KIF14Q15058 1648 aa24.56■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.56■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 RGS3P49796 1198 aa24.53■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.51■■□□□ 1.51
ZNF839-202ENST00000442396 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms