RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416826.6

VLDLR-AS1-201, VLDLR antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VLDLR-AS1, Length 3,167 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.25□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.24□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.24□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.23□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 TOPBP1Q92547 1522 aa11.23□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NCOA2Q15596 1464 aa11.23□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.23□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.22□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PKD2Q13563 968 aa11.22□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.22□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CUL7Q14999 1698 aa11.21□□□□□ -0.61
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.21□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 KLHL34Q8N239 644 aa11.2□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.19□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.19□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 GRIN2BQ13224 1484 aa11.19□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CCDC184Q52MB2 194 aa11.18□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.17□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 SAMD9Q5K651 1589 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NESP48681 1621 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.15□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.15□□□□□ -0.62
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.15□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.14□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ARHGEF11O15085 1522 aa11.14□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NBR1Q14596 966 aa11.13□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.13□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MRS2Q9HD23 443 aa11.12□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.12□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CCDC7Q96M83 1385 aa11.12□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.12□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NCOA1Q15788 1441 aa11.11□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 AKNAQ7Z591 1439 aa11.11□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.11□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.1□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.1□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 KDM6BO15054 1643 aa11.09□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 HECW1Q76N89 1606 aa11.09□□□□□ -0.63
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 IL27Q8NEV9 243 aa11.08□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.08□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 MIA2Q96PC5 1412 aa11.08□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.07□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.07□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.07□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ARID3CA6NKF2 412 aa11.06□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.05□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ROCK1Q13464 1354 aa11.03□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 FBXO3Q9UK99 471 aa11.02□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.02□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 DAPK1P53355 1430 aa11.01□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ABCC5O15440 1437 aa11□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NUDCQ9Y266 331 aa10.99□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.98□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 IFT140Q96RY7 1462 aa10.97□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 IQGAP2Q13576 1575 aa10.97□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.97□□□□□ -0.65
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.96□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 SHROOM2Q13796 1616 aa10.95□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 ZMYND15Q9H091 742 aa10.95□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 USP47Q96K76 1375 aa10.94□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 PZPP20742 1482 aa10.93□□□□□ -0.66
VLDLR-AS1-201ENST00000416826 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
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