RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000097343.10

Nelfe-201, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Nelfe, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Atp10dQ8K2X1 1416 aa35,79■■■■□ 3,32
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Col17a1Q07563 1470 aa35,78■■■■□ 3,32
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Caskin1Q6P9K8 1431 aa35,77■■■■□ 3,32
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rnf17Q99MV7 1640 aa35,76■■■■□ 3,31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Naip2Q9QUK4 1447 aa35,75■■■■□ 3,31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35,74■■■■□ 3,31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa35,72■■■■□ 3,31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm156Q58A37 223 aa35,72■■■■□ 3,31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Znf608Q56A10 1511 aa35,71■■■■□ 3,31
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 UacaQ8CGB3 1411 aa35,62■■■■□ 3,29
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ak9G3UYQ4 1894 aa35,53■■■■□ 3,28
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mtus2Q3UHD3 1353 aa35,51■■■■□ 3,28
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa35,41■■■■□ 3,26
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cabp1Q9JLK7 227 aa35,41■■■■□ 3,26
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Chic2Q9D9G3 165 aa35,4■■■■□ 3,26
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arid3cA6PWV5 409 aa35,38■■■■□ 3,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 SphkapQ6NSW3 1687 aa35,37■■■■□ 3,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Hecw1Q8K4P8 1604 aa35,37■■■■□ 3,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa35,36■■■■□ 3,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Trappc8E9PWG2 1437 aa35,36■■■■□ 3,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fmn2Q9JL04 1578 aa35,33■■■■□ 3,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP35,33■■■■□ 3,25
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Neurl4Q5NCX5 1563 aa35,32■■■■□ 3,24
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mast1Q9R1L5 1570 aa35,32■■■■□ 3,24
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kidins220E9Q9B7 1793 aa35,31■■■■□ 3,24
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa35,26■■■■□ 3,24
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fhod3Q76LL6 1578 aa35,24■■■■□ 3,23
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccer2J3QPU5 274 aa35,24■■■■□ 3,23
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NclP09405 707 aaKnown RBP35,22■■■■□ 3,23
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa35,21■■■■□ 3,23
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP35,17■■■■□ 3,22
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ttc37F8VPK0 1563 aa35,15■■■■□ 3,22
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa34,99■■■■□ 3,19
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Trpm2Q91YD4 1506 aa34,98■■■■□ 3,19
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP34,98■■■■□ 3,19
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm5cP41230 1554 aa34,96■■■■□ 3,19
Nelfe-201ENSMUST00000097343 OvosQ3UU35 1456 aa34,94■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ube2uB1AUC4 352 aa34,94■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP34,94■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ssh2Q5SW75 1423 aa34,93■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif21bQ9QXL1 1668 aa34,92■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zfp644E9QA22 1323 aa34,9■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abca17E9PX95 1733 aa34,89■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 AdgbG3UZ78 1657 aa34,89■■■■□ 3,18
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP34,87■■■■□ 3,17
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Atp10aO54827 1508 aa34,86■■■■□ 3,17
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mphosph9A6H5Y1 991 aa34,84■■■■□ 3,17
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eid3Q3V124 375 aa34,84■■■■□ 3,17
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Map3k5O35099 1380 aa34,84■■■■□ 3,17
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP34,81■■■■□ 3,16
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 TonslQ6NZL6 1363 aa34,75■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP34,75■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Clstn2Q9ER65 966 aa34,72■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP34,72■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 RereQ80TZ9 1558 aa34,71■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP34,71■■■■□ 3,15
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dip2cE9PWR4 1557 aa34,7■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Hecw2Q6I6G8 1578 aa34,7■■■■□ 3,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Synj2Q9D2G5 1434 aa34,69■■■■□ 3,14
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Map4P27546 1125 aaKnown RBP34,68■■■■□ 3,14
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa34,67■■■■□ 3,14
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ptch1Q61115 1434 aa34,67■■■■□ 3,14
Nelfe-201ENSMUST00000097343 ShprhQ7TPQ3 1674 aa34,67■■■■□ 3,14
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fndc1E9Q043 1732 aa34,66■■■■□ 3,14
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Asxl1P59598 1514 aa34,66■■■■□ 3,14
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