RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000097343.10

Nelfe-201, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Nelfe, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51,04■■■■■ 5,76
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NischQ80TM9 1593 aa50,78■■■■■ 5,72
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc9P70170 1546 aa49,35■■■■■ 5,49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc8B2RUS7 1588 aa48,76■■■■■ 5,4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 ScribQ80U72 1612 aa46,3■■■■■ 5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dcaf1Q80TR8 1506 aa45,34■■■■■ 4,85
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm5dQ62240 1548 aa45,04■■■■■ 4,8
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NacadQ5SWP3 1504 aa44,96■■■■■ 4,79
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rhox8Q6VSS7 320 aa44,9■■■■■ 4,78
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,39■■■■■ 4,7
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44,15■■■■■ 4,66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Sycp2Q9CUU3 1500 aa44,03■■■■■ 4,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Baz1aO88379 1555 aa43,88■■■■■ 4,61
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,54■■■■■ 4,56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rtl1Q7M732 1744 aa43,34■■■■■ 4,53
Nelfe-201ENSMUST00000097343 BicraF8VPZ9 1578 aa43,22■■■■■ 4,51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,89■■■■■ 4,46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,75■■■■■ 4,43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa41,98■■■■■ 4,31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa41,8■■■■■ 4,28
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41,78■■■■■ 4,28
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41,7■■■■■ 4,27
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41,58■■■■■ 4,25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41,54■■■■■ 4,24
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Synj1Q8CHC4 1574 aa41,36■■■■■ 4,21
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41,36■■■■■ 4,21
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Trim41Q5NCC3 630 aa41,31■■■■■ 4,2
Nelfe-201ENSMUST00000097343 CftrP26361 1476 aa41,3■■■■■ 4,2
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,28■■■■■ 4,2
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40,95■■■■■ 4,15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40,85■■■■■ 4,13
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40,82■■■■■ 4,13
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40,72■■■■■ 4,11
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Golga3P55937 1487 aa40,54■■■■■ 4,08
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40,46■■■■■ 4,07
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Top2bQ64511 1612 aa40,42■■■■■ 4,06
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40,3■■■■■ 4,04
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,29■■■■■ 4,04
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fam135aQ6NS59 1506 aa40,28■■■■■ 4,04
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cngb1E1AZ71 1325 aa40,17■■■■■ 4,02
Nelfe-201ENSMUST00000097343 HrcG5E8J6 738 aa40,17■■■■■ 4,02
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40,17■■■■■ 4,02
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa40,13■■■■■ 4,01
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Baz1bQ9Z277 1479 aa39,88■■■■□ 3,97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fmn1Q05860 1466 aa39,85■■■■□ 3,97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,85■■■■□ 3,97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 TnnQ80Z71 1560 aa39,83■■■■□ 3,97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39,83■■■■□ 3,97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa39,75■■■■□ 3,95
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cep164Q5DU05 1446 aa39,63■■■■□ 3,93
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif15Q6P9L6 1387 aa39,62■■■■□ 3,93
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39,62■■■■□ 3,93
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Chic1Q8CBW7 227 aa39,54■■■■□ 3,92
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP39,38■■■■□ 3,89
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cux2P70298 1426 aa39,33■■■■□ 3,89
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mrc2Q64449 1479 aa39,28■■■■□ 3,88
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,27■■■■□ 3,88
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,17■■■■□ 3,86
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Grin2bQ01097 1482 aa38,83■■■■□ 3,81
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38,81■■■■□ 3,8
Nelfe-201ENSMUST00000097343 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38,76■■■■□ 3,8
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NrkQ9R0G8 1455 aa38,75■■■■□ 3,79
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gab3Q8BSM5 595 aa38,7■■■■□ 3,79
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa38,69■■■■□ 3,78
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38,67■■■■□ 3,78
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Shroom4Q1W617 1475 aa38,62■■■■□ 3,77
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38,6■■■■□ 3,77
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PtprkP35822 1457 aa38,55■■■■□ 3,76
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Duox2A2AQ99 1517 aa38,51■■■■□ 3,75
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Crocc2F6XLV1 1638 aa38,5■■■■□ 3,75
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Efcab5A0JP43 1406 aa38,49■■■■□ 3,75
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP38,42■■■■□ 3,74
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38,36■■■■□ 3,73
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cep162Q6ZQ06 1403 aa38,35■■■■□ 3,73
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Samd9lQ69Z37 1561 aa38,28■■■■□ 3,72
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Npm2Q80W85 207 aa38,27■■■■□ 3,72
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38,24■■■■□ 3,71
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Plb1Q3TTY0 1478 aa38,22■■■■□ 3,71
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38,2■■■■□ 3,71
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Map3k1P53349 1493 aa38,18■■■■□ 3,7
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38,15■■■■□ 3,7
Nelfe-201ENSMUST00000097343 SynmQ70IV5 1561 aa38,04■■■■□ 3,68
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ift140E9PY46 1464 aa38,01■■■■□ 3,68
Nelfe-201ENSMUST00000097343 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP37,98■■■■□ 3,67
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Disp1Q3TDN0 1521 aa37,92■■■■□ 3,66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37,91■■■■□ 3,66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37,91■■■■□ 3,66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zeb1Q64318 1117 aa37,86■■■■□ 3,65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37,86■■■■□ 3,65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Magi3Q9EQJ9 1476 aa37,85■■■■□ 3,65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37,84■■■■□ 3,65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Carmil1Q6EDY6 1374 aa37,8■■■■□ 3,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Myt1lP97500 1187 aa37,79■■■■□ 3,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Clip1Q922J3 1391 aa37,77■■■■□ 3,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Grin2aP35436 1464 aa37,77■■■■□ 3,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37,77■■■■□ 3,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pla2r1Q62028 1487 aa37,76■■■■□ 3,64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37,76■■■■□ 3,63
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