RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029773.12

Cnn3-201, Transcript of Calponin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnn3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Naip2Q9QUK4 1447 aa28.01■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Atp10dQ8K2X1 1416 aa28■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa27.99■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mia2Q91ZV0 1396 aa27.98■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NefmP08553 848 aa27.97■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Caskin1Q6P9K8 1431 aa27.96■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca8bQ8K440 1620 aa27.95■■■□□ 2.07
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm156Q58A37 223 aa27.95■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Plekhh2Q8C115 1491 aa27.94■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa27.94■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abcc5Q9R1X5 1436 aa27.94■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Znf608Q56A10 1511 aa27.93■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa27.93■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fhad1A6PWD2 1420 aa27.91■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 UacaQ8CGB3 1411 aa27.91■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tdrd9Q14BI7 1383 aa27.91■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Chic2Q9D9G3 165 aa27.91■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rnf17Q99MV7 1640 aa27.9■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mtus2Q3UHD3 1353 aa27.9■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.89■■■□□ 2.06
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgap5P97393 1501 aa27.88■■■□□ 2.05
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Vps8Q0P5W1 1427 aa27.87■■■□□ 2.05
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Col17a1Q07563 1470 aa27.86■■■□□ 2.05
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cabp1Q9JLK7 227 aa27.82■■■□□ 2.04
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arid3cA6PWV5 409 aa27.8■■■□□ 2.04
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rfx7F8VPJ6 1459 aa27.8■■■□□ 2.04
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Il16O54824 1322 aa27.77■■■□□ 2.04
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Setbp1Q9Z180 1582 aa27.77■■■□□ 2.04
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa27.76■■■□□ 2.03
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cfap74Q3UY96 1578 aa27.76■■■□□ 2.03
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ak9G3UYQ4 1894 aa27.72■■■□□ 2.03
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NclP09405 707 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa27.7■■■□□ 2.03
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Trappc8E9PWG2 1437 aa27.7■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccer2J3QPU5 274 aa27.68■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zfyve16Q80U44 1528 aa27.67■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 SphkapQ6NSW3 1687 aa27.67■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa27.66■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ube2uB1AUC4 352 aa27.65■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abcc3B2RX12 1523 aa27.64■■■□□ 2.02
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa27.64■■■□□ 2.01
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pprc1Q6NZN1 1644 aa27.62■■■□□ 2.01
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fmn2Q9JL04 1578 aa27.6■■■□□ 2.01
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Hecw1Q8K4P8 1604 aa27.58■■■□□ 2.01
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca9Q8K449 1623 aa27.56■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kidins220E9Q9B7 1793 aa27.55■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Eid3Q3V124 375 aa27.54■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mast1Q9R1L5 1570 aa27.54■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Neurl4Q5NCX5 1563 aa27.53■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fhod3Q76LL6 1578 aa27.52■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa27.52■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa27.5■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa27.5■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa27.49■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.47■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 AlkP97793 1621 aa27.45■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zfp644E9QA22 1323 aa27.45■■□□□ 1.99
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lemd3Q9WU40 921 aa27.44■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Depdc5P61460 1591 aa27.43■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TonslQ6NZL6 1363 aa27.43■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 AglF8VPN4 1532 aa27.42■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pcgf6Q99NA9 353 aa27.42■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Prdm16A2A935 1275 aa27.41■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mphosph9A6H5Y1 991 aa27.4■■□□□ 1.98
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ttc37F8VPK0 1563 aa27.38■■□□□ 1.97
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ssh2Q5SW75 1423 aa27.36■■□□□ 1.97
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Map3k5O35099 1380 aa27.34■■□□□ 1.97
Cnn3-201ENSMUST00000029773 OvosQ3UU35 1456 aa27.34■■□□□ 1.97
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Trpm2Q91YD4 1506 aa27.33■■□□□ 1.96
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Clstn2Q9ER65 966 aa27.27■■□□□ 1.96
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm5cP41230 1554 aa27.26■■□□□ 1.96
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Map4P27546 1125 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ttll5Q8CHB8 1328 aa27.25■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nos1Q9Z0J4 1429 aa27.23■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kif21bQ9QXL1 1668 aa27.23■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kiaa0556Q8C753 1610 aa27.22■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa27.22■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Atp10aO54827 1508 aa27.21■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca17E9PX95 1733 aa27.2■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pkd2O35245 966 aa27.19■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dnajc5P60904 198 aa27.18■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Trak1Q6PD31 939 aa27.17■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 AdgbG3UZ78 1657 aa27.17■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ptch1Q61115 1434 aa27.15■■□□□ 1.94
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PtprgQ05909 1442 aa27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 117.3 ms