RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021338.9

Ap4s1-201, Transcript of AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ap4s1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa29.49■■■□□ 2.31
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Arid3cA6PWV5 409 aa29.46■■■□□ 2.31
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Lmod2Q3UHZ5 550 aa29.44■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Zfyve16Q80U44 1528 aa29.44■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 AglF8VPN4 1532 aa29.43■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 AdgbG3UZ78 1657 aa29.42■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rnf17Q99MV7 1640 aa29.41■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa29.41■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 A2mQ6GQT1 1474 aa29.39■■■□□ 2.3
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa29.37■■■□□ 2.29
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Depdc5P61460 1591 aa29.35■■■□□ 2.29
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ccnb3Q810T2 1396 aa29.31■■■□□ 2.28
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Caskin1Q6P9K8 1431 aa29.3■■■□□ 2.28
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Arhgap5P97393 1501 aa29.25■■■□□ 2.27
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cfap74Q3UY96 1578 aa29.24■■■□□ 2.27
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa29.22■■■□□ 2.27
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Adcy10Q8C0T9 1614 aa29.21■■■□□ 2.27
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abca9Q8K449 1623 aa29.19■■■□□ 2.26
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29.15■■■□□ 2.26
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abcc3B2RX12 1523 aa29.13■■■□□ 2.25
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kiaa0556Q8C753 1610 aa29.11■■■□□ 2.25
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa29.1■■■□□ 2.25
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Tdrd9Q14BI7 1383 aa29.1■■■□□ 2.25
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa29.1■■■□□ 2.25
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Fndc1E9Q043 1732 aa29.08■■■□□ 2.25
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29.03■■■□□ 2.24
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Hecw1Q8K4P8 1604 aa29■■■□□ 2.23
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Synj2Q9D2G5 1434 aa29■■■□□ 2.23
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Trappc8E9PWG2 1437 aa28.99■■■□□ 2.23
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa28.98■■■□□ 2.23
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 OvosQ3UU35 1456 aa28.97■■■□□ 2.23
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Lemd3Q9WU40 921 aa28.96■■■□□ 2.23
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Neurl4Q5NCX5 1563 aa28.95■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa28.94■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kdm5cP41230 1554 aa28.94■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.94■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Plekhh2Q8C115 1491 aa28.94■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abcc5Q9R1X5 1436 aa28.91■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mtus2Q3UHD3 1353 aa28.9■■■□□ 2.22
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Atp10aO54827 1508 aa28.89■■■□□ 2.21
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mast1Q9R1L5 1570 aa28.87■■■□□ 2.21
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 UbtfP25976 765 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Il16O54824 1322 aa28.83■■■□□ 2.21
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.81■■■□□ 2.2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 SphkapQ6NSW3 1687 aa28.79■■■□□ 2.2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Fmn2Q9JL04 1578 aa28.79■■■□□ 2.2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 UacaQ8CGB3 1411 aa28.78■■■□□ 2.2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Prdm16A2A935 1275 aa28.75■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa28.74■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 RereQ80TZ9 1558 aa28.74■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.73■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Naip2Q9QUK4 1447 aa28.73■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rfx7F8VPJ6 1459 aa28.72■■■□□ 2.19
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa28.7■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.69■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ptch1Q61115 1434 aa28.68■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Fhod3Q76LL6 1578 aa28.67■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.67■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cul9Q80TT8 1865 aa28.66■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cabp1Q9JLK7 227 aa28.66■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mia2Q91ZV0 1396 aa28.64■■■□□ 2.18
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Yeats2Q3TUF7 1407 aa28.6■■■□□ 2.17
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 NpatQ8BMA5 1420 aa28.59■■■□□ 2.17
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Alpk3Q924C5 1678 aa28.58■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 NclP09405 707 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.56■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Map3k5O35099 1380 aa28.55■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa28.54■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Plch2A2AP18 1501 aa28.54■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Fhad1A6PWD2 1420 aa28.54■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Chic2Q9D9G3 165 aa28.54■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Camsap2Q8C1B1 1461 aa28.53■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abca17E9PX95 1733 aa28.53■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Qser1A2BIE1 1698 aa28.53■■■□□ 2.16
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Vps8Q0P5W1 1427 aa28.51■■■□□ 2.15
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dnajc5gQ8C632 165 aa28.5■■■□□ 2.15
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa28.5■■■□□ 2.15
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Uggt2E9Q4X2 1504 aa28.47■■■□□ 2.15
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Gli2Q0VGT2 1544 aa28.47■■■□□ 2.15
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.45■■■□□ 2.15
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa28.45■■■□□ 2.14
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ssh2Q5SW75 1423 aa28.43■■■□□ 2.14
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Naip6Q9JIB6 1403 aa28.43■■■□□ 2.14
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rsph4aQ8BYM7 716 aa28.37■■■□□ 2.13
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Plppr3Q7TPB0 716 aa28.35■■■□□ 2.13
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.34■■■□□ 2.13
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Clstn2Q9ER65 966 aa28.34■■■□□ 2.13
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Talpid3E9PV87 1520 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms