RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C AGP1P25376 633 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KAR4P25583 335 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CPR3P25719 182 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CAB3P36076 571 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RRN10P38204 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C EMP65P40085 556 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YNL320WP42840 284 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C JHD2P47156 728 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C NHP10Q03435 203 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HDA3Q06623 655 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C REH1Q06709 432 aa6.69□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C AI3P03877 415 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C PRP6P19735 899 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MCM5P29496 775 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YEL043WP32618 956 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C PTM1P32857 523 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MET30P39014 640 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YER034WP40022 185 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C VRG4P40107 337 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YIL152WP40455 235 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SEC24P40482 926 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C INA22P40576 216 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HOC1P47124 396 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C LCL3P53153 274 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C ERG13P54839 491 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YET2Q04210 160 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YLR177WQ06251 628 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C VAM6Q07468 1049 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C XYL2Q07993 356 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RAX1Q08760 435 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C UBX3Q12229 455 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RMP1Q12530 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CDC9P04819 755 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SEC14P24280 304 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YJU2P28320 278 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C BYE1P36106 594 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MBP1P39678 833 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KXD1P53158 218 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C FMP45Q07651 309 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RGT2Q12300 763 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YMR030W-AQ3E760 96 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.67□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CYT1P07143 309 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data6.66□□□□□ -1.34not detected
SPE3YPR069C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C NAR1P23503 491 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CHA1P25379 360 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C AAD3P25612 363 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C BUD14P27637 709 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C FAA1P30624 700 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C PMT2P31382 759 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HXT4P32467 576 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SDH3P33421 198 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPC37P36121 282 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KAE1P36132 386 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPS27BP38711 82 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HXT6P39003 570 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HXT7P39004 570 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CCT2P39076 527 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SHY1P53266 389 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C TAF12Q03761 539 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YDR338CQ05497 695 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C CRN1Q06440 651 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C AKR2Q12013 749 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MDY2Q12285 212 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C GLO4Q12320 285 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KCS1Q12494 1050 aa6.66□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C DPB3P27344 201 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C ETR1P38071 380 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HOS4P40480 1083 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C APQ12P40532 138 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C TEL2P53038 688 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MAL13P53338 473 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YNL260CP53846 198 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YNL058CP53947 316 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SRP1Q02821 542 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C OMS1Q06668 471 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YET3Q07451 203 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C MMT2Q08970 484 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C HUA2Q12134 243 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C YPR011CQ12251 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C SRN2Q99176 213 aa6.65□□□□□ -1.34
SPE3YPR069C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C MGR1P25573 417 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C YCR102CP25608 368 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C NAM9P27929 486 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C ERG1P32476 496 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C CDC5P32562 705 aa6.64□□□□□ -1.35
SPE3YPR069C VRP1P37370 817 aa6.64□□□□□ -1.35
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