RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	DSD1	P53095	428 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MRPL35	Q06678	367 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SKM1	Q12469	655 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YKL100C	P34248	587 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	GEX2	P36173	615 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	VID24	P38263	362 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	FMP10	P40098	244 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ENT1	Q12518	454 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	BOS1	P25385	244 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PEP3	P27801	918 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SPR1	P32603	445 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ARP1	P38696	384 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	HAT2	P39984	401 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	TMA108	P40462	946 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YGR127W	P53275	312 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SLD5	Q03406	294 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	TCO89	Q08921	799 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MAL33	P38157	468 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PAF1	P38351	445 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PHO92	Q06390	306 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	DBF20	P32328	564 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ALY1	P36117	915 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	LCL3	P53153	274 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	GPI1	P53306	609 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ATG16	Q03818	150 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PSK2	Q08217	1101 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YPL199C	Q08954	240 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	HUA2	Q12134	243 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	HSL1	P34244	1518 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	CHS1	P08004	1131 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PSY4	P38193	441 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	IFA38	P38286	347 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	CBK1	P53894	756 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ERV2	Q12284	196 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	NKP1	Q12493	238 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	VCX1	Q99385	411 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	NDI1	P32340	513 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YHL041W	P38730	149 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PSD1	P39006	500 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	DOT5	P40553	215 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	LYS14	P40971	790 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	POP6	P53218	158 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	UBX4	P54730	416 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	BNI1	P41832	1953 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	HIP1	P06775	603 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MSS18	P08593	268 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MSM1	P22438	575 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	IMG1	P25626	169 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PAH1	P32567	862 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	AVT4	P50944	713 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	NBP2	Q12163	236 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ADH7	P25377	361 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YCL049C	P25577	312 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YBL029W	P38201	376 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	TPM2	P40414	161 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SAP185	P40856	1058 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	VPS4	P52917	437 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SGS1	P35187	1447 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	FRE2	P36033	711 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ACA1	P39970	489 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	IOC4	Q04213	475 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	POL4	P25615	582 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MNS1	P32906	549 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	REG2	P38232	338 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YHR131C	P38835	850 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	TGL2	P54857	326 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	SNO4	Q04902	237 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MUM3	Q08750	479 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	HSP32	Q08992	237 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	REV3	P14284	1504 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	IPI3	P53877	555 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	MUB1	Q03162	620 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YML037C	Q03703	340 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	VHS1	Q03785	461 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ECM11	Q04110	302 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	YPR091C	Q06833	770 aa		0.9	□□□□□ -2.26
HAL9	YOL089C	ATP4	P05626	244 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YAR066W	P0CX18	203 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YHR214W	P0CX19	203 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27

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