RNA–Protein interactions for RNA: YNL218W

MGS1, Transcript of Protein with DNA-dependent ATPase and ssDNA annealing activities, yeast

Gene MGS1, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGS1	YNL218W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RSR1	P13856	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GLN3	P18494	730 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	DBF2	P22204	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GIT1	P25346	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	STB6	P36085	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MRPL17	P36528	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	AGP2	P38090	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ECM13	P38195	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YHL041W	P38730	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MUP3	P38734	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YAR028W	P39548	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	BST1	P43571	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MGS1	YNL218W	GUF1	P46943	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	HOC1	P47124	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GTO1	P48239	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SPC105	P53148	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SCW11	P53189	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ARP4	P80428	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SPP2	Q02521	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SMA1	Q02651	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	BLS1	Q06071	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	CRN1	Q06440	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	CDD1	Q06549	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	UBX3	Q12229	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	FRT1	Q99332	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GSC2	P40989	1895 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SUC2	P00724	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	CAP2	P13517	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	EMC1	P25574	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SCD5	P34758	872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	CLG1	P35190	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YBR053C	P38235	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ARN2	P38724	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YHR131C	P38835	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YHR219W	P38900	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RAD55	P38953	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	HXT7	P39004	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	FHL1	P39521	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ACO2	P39533	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SWD1	P39706	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GIP4	P39732	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YER186C	P40101	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MAF1	P41910	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	IRC6	P43615	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YJR154W	P47181	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MGS1	YNL218W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	INA17	Q02888	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GAS3	Q03655	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SPO20	Q04359	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	COA4	Q05809	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	REH1	Q06709	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	LDB18	Q07887	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	PGC1	Q08959	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	BAG7	Q12128	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	NBP2	Q12163	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	TSC13	Q99190	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SEN2	P16658	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MGS1	YNL218W	CLN2	P20438	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GRR1	P24814	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YCL049C	P25577	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	YIH1	P25637	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	BEM1	P29366	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	NTG1	P31378	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	HIR2	P32480	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	MRPL7	P36519	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SSN3	P39073	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	ELO3	P40319	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	AYR1	P40471	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	GYP8	P43570	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MGS1	YNL218W	SNF12	P53628	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms