RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	STE3	P06783	470 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PMA2	P19657	947 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RML2	P32611	393 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ALG5	P40350	334 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PRK1	P40494	810 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YJL107C	P42947	387 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YJL132W	P47014	750 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YGR149W	P48236	432 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	BRO1	P48582	844 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	CTR1	P49573	406 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SRL4	Q03085	281 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ERV41	Q04651	352 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	AEP3	Q12089	606 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SAC7	P17121	654 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	UGA1	P17649	471 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	GEX1	P25596	615 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MTC7	P32633	139 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	GEX2	P36173	615 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SFB3	P38810	929 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YHR182W	P38870	785 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SCC4	P40090	624 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YFL054C	P43549	646 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	FMS1	P50264	508 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RPM2	Q02773	1202 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	UBP16	Q02863	499 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	OSW2	Q12202	724 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YOS9	Q99220	542 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MRP10	O75012	95 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SPO7	P18410	259 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	DEP1	P31385	405 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	OCT1	P35999	772 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SER3	P40054	469 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	FMC1	P40491	155 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	IME4	P41833	600 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	TOM22	P49334	152 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	TIM21	P53220	239 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SKO1	Q02100	647 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ACL4	Q03771	387 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YLR346C	Q06139	101 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MED2	Q12124	431 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YCL068C	P25593	260 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PTR2	P32901	601 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YHR045W	P38775	560 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ELO3	P40319	345 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	CTK2	P46962	323 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YJL045W	P47052	634 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	URB2	P47108	1174 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YGL114W	P53134	725 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	GPN3	Q06543	272 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	XYL2	Q07993	356 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	FRE3	Q08905	711 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	SLP1	Q12232	587 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	FAB1	P34756	2278 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	COQ4	O13525	335 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YPK2	P18961	677 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	END3	P39013	349 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	GID8	P40208	455 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	MAF1	P41910	395 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YHC3	P47040	408 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ABM1	P47146	123 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	TAM41	P53230	385 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YGR126W	P53274	230 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ELG1	Q12050	791 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	FLO1	P32768	1537 aa		3.65	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.65	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	CKA2	P19454	339 aa		3.65	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	PEX1	P24004	1043 aa		3.65	□□□□□ -1.82
YKL050C	YKL050C	ADY2	P25613	283 aa		3.65	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms