RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HUA2	Q12134	243 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CLN2	P20438	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	DAL81	P21657	970 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SGF29	P25554	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	NGG1	P32494	702 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	HCS1	P34243	683 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GTS1	P40956	396 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IME4	P41833	600 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MDE1	P47095	244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CSN12	P47130	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YNL033W	P53964	284 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YNL019C	P53975	284 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ECM9	Q02202	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TOF2	Q02208	771 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SRL4	Q03085	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GPB1	Q08886	897 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TFB4	Q12004	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ULA1	Q12059	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MCD1	Q12158	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FRT1	Q99332	602 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SPS1	P08458	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CIN8	P27895	1000 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PEX6	P33760	1030 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YKL100C	P34248	587 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YBR241C	P38142	488 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TDP1	P38319	544 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YBR285W	P38354	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	EXO1	P39875	702 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ECM10	P39987	644 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	JHD1	P40034	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IRC5	P43610	853 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	AIM14	P53109	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	LOT6	Q07923	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GYP1	Q08484	637 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	NDD1	Q08887	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PSY3	Q12318	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SUC2	P00724	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SPT3	P06844	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MNE1	P24720	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CTR86	P25355	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	POL4	P25615	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ISF1	P32488	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	LIP5	P32875	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SCD5	P34758	872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	THI80	P35202	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ALY1	P36117	915 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ROT2	P38138	954 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FAA2	P39518	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GIP4	P39732	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YRB2	P40517	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GCD10	P41814	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MSE1	P48525	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ARP4	P80428	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	HEH2	Q03281	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	VTA1	Q06263	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	NTG2	Q08214	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FLC1	Q08967	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TGL5	Q12043	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	UPC2	Q12151	913 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GTT2	Q12390	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MRP13	P12686	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TOP3	P13099	656 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CBS2	P14905	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	UGA1	P17649	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PMA2	P19657	947 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	VPS33	P20795	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GEX1	P25596	615 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MRPL9	P31334	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	STE14	P32584	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	TIP20	P33891	701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MDJ1	P35191	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PHO11	P35842	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SKG1	P36169	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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