RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C MSS51P32335 436 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STE14P32584 239 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SKT5P34226 696 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HCS1P34243 683 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRPL7P36519 292 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRPL17P36528 281 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YAP1801P38856 637 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CEM1P39525 442 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SWD1P39706 426 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RSP5P39940 809 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TPA1P40032 644 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C VMA13P41807 478 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GCD10P41814 478 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C AIM23P47015 356 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YJR154WP47181 346 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GPI8P49018 411 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STB4P50104 949 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MON1P53129 644 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TWF1P53250 332 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.25□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C ARE2P53629 642 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BRE5P53741 515 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COG5P53951 403 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RSC4Q02206 625 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PET117Q02771 107 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C INA17Q02888 182 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ABZ2Q03266 374 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARA2Q04212 335 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SWC7Q06707 132 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YLR049CQ12110 428 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C UBX3Q12229 455 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MDM12Q92328 271 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HIS1P00498 297 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CIT2P08679 460 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GIT1P25346 518 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YIH1P25637 258 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ACH1P32316 526 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PTM1P32857 523 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CLG1P35190 452 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ECM13P38195 257 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YHR045WP38775 560 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FHL1P39521 936 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C EDC3P39998 551 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C AYR1P40471 297 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DLD2P46681 530 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PET130P47065 347 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C EFM3P47163 339 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NCS6P53088 359 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ALG12P53730 551 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARP4P80428 489 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ISU1Q03020 165 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FIN1Q03898 291 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ECM11Q04110 302 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PPN1Q04119 674 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BCH1Q05029 724 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NEJ1Q06148 342 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MCP2Q06567 569 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MDM36Q06820 579 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MFG1Q07684 458 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GPB1Q08886 897 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YPL191CQ08930 360 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NBP2Q12163 236 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BBP1Q12365 385 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C RMD5Q12508 421 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YPL119C-AQ3E751 87 aa5.24□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COX5AP00424 153 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPP2BP02400 110 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YCL049CP25577 312 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PTC6P25646 442 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BEM1P29366 551 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARP2P32381 391 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRS6P32864 603 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STB6P36085 766 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RIB1P38066 345 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YHL041WP38730 149 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YHR131CP38835 850 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GDH3P39708 457 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YEL020CP39994 560 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PEA2P40091 420 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HOC1P47124 396 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MSE1P48525 536 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SAP4P53036 818 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MET13P53128 600 aa5.23□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C EFM6P53970 246 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms