RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	SWC4	P53201	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PET117	Q02771	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TFB2	Q02939	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CCE1	Q03702	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CIA1	Q05583	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	BUD7	Q08754	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	NPC2	Q12408	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	COX3	P00420	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SUC2	P00724	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RAD1	P06777	1100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	EPT1	P22140	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	STE14	P32584	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RML2	P32611	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PHO11	P35842	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SRX1	P36077	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PHO12	P38693	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SDP1	P40479	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	IME4	P41833	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SHR5	P41912	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YFL012W	P43580	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YFR018C	P43599	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	COQ5	P49017	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	VAC7	P53950	1165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	STE23	Q06010	1027 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	BLS1	Q06071	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	VHS3	Q08438	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SLD7	Q08457	257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	GTT2	Q12390	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SNT1	P25357	1226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	BEM1	P29366	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	LDB7	P38210	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YSW1	P38280	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SPC97	P38863	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CTF8	P38877	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	REV7	P38927	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PUS6	YGR169C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CCT6	P39079	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YJL070C	P40361	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HXT16	P47185	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ZIP2	P53061	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SLT2	Q00772	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CDC123	Q05791	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	VTA1	Q06263	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ATG10	Q07879	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	DIF1	O13577	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	INH1	P01097	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ABF1	P14164	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PUS6	YGR169C	TFB1	P32776	642 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ETR1	P38071	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	IML3	P38265	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TAE1	P38340	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	DBP8	P38719	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YHI9	P38765	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PCL5	P38794	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HAT2	P39984	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	DSN1	P40568	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	PET130	P47065	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	URB2	P47108	1174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YGL108C	P53139	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ARG7	Q04728	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	CRR1	Q05790	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	YET3	Q07451	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUS6	YGR169C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YCR099C	P25657	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MSH1	P25846	959 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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