RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	PRM9	P39551	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ERV46	P39727	415 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CAF16	P43569	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GUF1	P46943	645 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YJR030C	P47101	745 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PIB2	P53191	635 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SWC4	P53201	476 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YGR021W	P53212	290 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MAL12	P53341	584 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PEX25	Q02969	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YDR090C	Q03193	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YML037C	Q03703	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YDR387C	Q04162	555 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SIZ1	Q04195	904 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	FRE3	Q08905	711 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	HAT1	Q12341	374 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.57	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MET17	P06106	444 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MRP7	P12687	371 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SLY1	P22213	666 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPD3	P32561	433 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SEF1	P34228	1148 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TOS1	P38288	455 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ERV15	P38312	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RSC30	P38781	883 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BZZ1	P38822	633 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RGI2	P40188	164 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BST1	P43571	1029 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YJL043W	P47053	257 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PEX8	P53248	589 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	VPS62	P53285	467 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PRM1	P53835	661 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
XRS2	YDR369C	OCA2	P53949	197 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CSN9	Q03981	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BSC2	Q05611	235 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IMA2	Q08295	589 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GIS3	Q12418	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MED11	Q99278	115 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	COB	P00163	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TPK3	P05986	398 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CAP2	P13517	287 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MRPL44	P19956	98 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GLC3	P32775	704 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	VPS17	P32913	551 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YKL077W	P36081	392 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SPC34	P36131	295 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YHR182W	P38870	785 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PCL7	P40186	285 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TOK1	P40310	691 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RFC2	P40348	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	VHR1	P40522	640 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MAD2	P40958	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RRN7	P40992	514 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	AGP3	P43548	558 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DAK2	P43550	591 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RTT101	P47050	842 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YJR107W	P47145	328 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SPT20	P50875	604 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PPT1	P53043	513 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RCF2	P53721	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TEP1	P53916	434 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ARP4	P80428	489 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PEX13	P80667	386 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BOP2	Q06150	570 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YPS7	Q06325	596 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PIB1	Q06651	286 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	HAL9	Q12180	1030 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BMT6	Q12291	365 aa		3.56	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CTT1	P06115	562 aa		3.55	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CBF1	P17106	351 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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