RNA–Protein interactions for RNA: YDR063W

AIM7, Transcript of Protein that interacts with Arp2/3 complex, yeast

Gene AIM7, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM7	YDR063W	MRP21	P38175	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	DBP8	P38719	431 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	YHI9	P38765	294 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	RPH1	P39956	796 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	YEL073C	P39974	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	NDC80	P40460	691 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	GAT1	P43574	510 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	TIS11	P47977	285 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	BUL1	P48524	976 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	SGF73	P53165	657 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	STP3	Q05937	343 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	BNA5	Q05979	453 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CDA1	Q06702	301 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	GPR1	Q12361	961 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	LAS17	Q12446	633 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	INO1	P11986	533 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	ERG4	P25340	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	PLC1	P32383	869 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	ATP11	P32453	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	UBA4	P38820	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	UME6	P39001	836 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	MGS1	P40151	587 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	YFR020W	P43600	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	YGL108C	P53139	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	EFM6	P53970	246 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	PET117	Q02771	107 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	VTI1	Q04338	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CRN1	Q06440	651 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	RSC3	Q06639	885 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	XYL2	Q07993	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	PLB3	Q08108	686 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	BUD7	Q08754	746 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	NUS1	Q12063	375 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	PST1	Q12355	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	WHI5	Q12416	295 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	RMP1	Q12530	201 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	ABF1	P14164	731 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	HEM15	P16622	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	KAR4	P25583	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	URA10	P30402	227 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	ARA1	P38115	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	IME4	P41833	600 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	PXA1	P41909	870 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	SSU1	P41930	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	BIR1	P47134	954 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	RNT1	Q02555	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	TFB2	Q02939	513 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	HOS1	Q12214	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM7	YDR063W	CDC21	P06785	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	RIP1	P08067	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	STE4	P18851	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	DAL82	P21705	255 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	ATP12	P22135	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	YCR006C	P25350	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	AAD3	P25612	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	PIM1	P36775	1133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	SOL2	P37262	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	YHR182W	P38870	785 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
AIM7	YDR063W	YAL037W	P39728	267 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	YER158C	P40095	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	LRO1	P40345	661 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	MAD1	P40957	749 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	AZF1	P41696	914 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	PFA3	P42836	336 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	FET5	P43561	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	RTA1	P53047	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	PEX8	P53248	589 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	FHN1	P53279	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	BUD32	P53323	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	COG6	P53959	839 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	CDC123	Q05791	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	TGL5	Q12043	749 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM7	YDR063W	UBX3	Q12229	455 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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